Лишай у домашней кошки: Стригущий лишай у кошек: как выглядит и чем лечить — Здоровье Животных

Что делать, если у кошки лишай?

Откуда у кошки лишай?

Лишай — это заболевание, которое вызывают микроскопические патогенные грибы. Ученые называют их дерматофитами. Они выделяются больными животными и способны выживать в окружающей среде в течение длительного времени. Из-за небольшого веса дерматофиты легко переносятся по воздуху и оседают на различных предметах или почве. Оттуда их споры чаще всего попадают в жилище человека, например, с частичками пыли и грязи на обуви.

Оказавшись в благоприятных условиях, дерматофиты передаются от животного к животному или от животного — человеку. Особенно к ним восприимчивы котята и питомцы с ослабленным иммунитетом, поэтому они заражаются лишаем в первую очередь.

Как определить лишай у кошки

Самый первый признак — сыпь, правда владельцы часто не замечают ее, особенно если у питомца длинная густая шерсть. Она может сопровождаться зудом, и тогда кошка становится тревожной и начинает сильно расчесывать кожу.

Спустя две-три недели после заражения на голове и передних лапах появляются небольшие округлые участки без шерсти с шелушением и корочками. Они могут быть одиночными или сливающимися, а в запущенных случаях поражают еще и кончик хвоста.

Если вы обнаружили симптомы лишая у своей кошки, немедленно обратитесь к ветеринару и начинайте лечение. Это заболевание угрожает не только животным, но и людям, и, если вовремя не оказать питомцу помощь, характерные поражения кожи могут появиться и у вас.

Лечение и профилактика лишая у кошек

Чтобы установить точный диагноз, недостаточно визуального осмотра. Клиническая картина лишая достаточно разнообразна, поэтому подтвердить его может только комбинация диагностических тестов.

В клинике вам предложат исследование под микроскопом отдельных волосков, собранных с пораженных мест; сбор и посев материала на питательную среду, а также люминесцентную диагностику или тест с лампой Вуда – ультрафиолетовым светильником с длинноволновым излучением.

Если после всех проведенных тестов наличие лишая у питомца подтвердится, ветеринар назначит необходимое лечение. Оно будет зависеть от степени и сложности заболевания. Животному могут прописать прием противогрибковых препаратов или обработку кожи специальными средствами. Также рекомендуется провести дезинфекцию жилища, чтобы удалить споры дерматофитов и избежать повторного заражения.

Не пытайтесь лечить кошку народными средствами — это может быть неэффективно, затратно и даже опасно для ее жизни. Лучше доверьте диагностику и терапию ветеринарному врачу, и совсем скоро ваш пушистый любимец вновь будет здоров.

24 Октября 2017г.

ᐉ Лишай у кошки — Домашняя живность

не просто редкость, а почти нонсенс.

Я болела трижды, дочка два раза. Лечились поверхностно. Ничего не выбрасывали и ны мыли. За неделю все ушло от фукорцина.

Скорее нужно обратить внимание на иммунитет ребенка, а лишай действительно больше цепляется именно на деток и на женщин.

Но опять же — в данном случае, речь пока не идет о лишае. Заболеваний, взывающих выпадение шерсти, очень много и далеко не все они опасны.

 

То, что было у нас — не массовое явление, но достаточно часто встречающееся. Поверьте, я не забуду того ужаса, который видела в стационаре (мы туда ходили на консультации, а детки там лежали по месяцу, без мам, и было их не мало). Болеют действительно в основном дети, сейчас уже не вспомню подробностей, но их организм пока чего-то там не вырабатывает и поэтому не может противостоять.

Фразы из мед.справочников, в свое время я их выучила наизусть. Советую почитать, прежде чем проявлять заботу о кошечках.

 

Лечение микроспории (стригущего лишая).

 

Проводится в стационаре и амбулаторно. При поражении только гладкой кожи очаги смазывают утром 2-20 % йодной настойкой и вечером 5-10 % серно-салициловой мазью в течение нескольких недель, т.е. до полного исчезновения очагов поражения. При поражении волосистой части головы волосы в очагах сбривают 1 раз в неделю и очаги смазывают утром 2-5 % спиртовым раствором йода, на ночь — 5 % серно-салициловой или 5-10 % серно-дегтярной мазью. Рекомендуется также через день мыть голову горячей водой с мылом. Одновременно назначают внутрь гризеофульвин в таблетках из расчета 22 мг на 1 кг тела ежедневно (на 20-25 дней). Противогрибковый антибиотик гризеофульвин, назначается на 1,5 – 2 месяца в высоких дозах, так как возбудитель микроспории очень устойчив по отношению к любым воздействиям. Гризеофульвин нельзя принимать самостоятельно (только по назначению врача), так как он достаточно токсичен и имеет ряд противопоказаний. После получения первого отрицательного анализа на грибы, гризеофульвин назначают через день в течение 2 недель, а затем через 3 дня в течение еще 2 недель до полного выздоровления. У детей с противопоказаниями к гризеофульвинотерапии рекомендовано удалять волосы 4 % анилиновым пластырем. Предварительно волосы сбривают, пластырь наносят тонким слоем на очаги. Детям до 6 лет пластырь накладывают однократно на 15-18 дней, а детям старшего возраста — дважды, меняя повязку через 8-10 дней. Обычно волосы выпадают через 21-24 дня. Затем назначают фунгицидные средства. При инфильтративно-нагноительной трихофитии лечение начинают с удаления корок, имеющихся в очагах поражения, с помощью повязок с 2 % салициловым вазелином. Затем производят ручную эпиляцию (удаление) волос с помощью пинцета как в очагах, так на 1 см в их окружности. В дальнейшем назначают влажно-высыхающие повязки из ОД % раствора этакридина лактата, 10 % водного раствора ихтиола или буровской жидкости. После ликвидации острого воспаления применяют 10-15 % серно-дегтярную, 10 % серно-салициловую мази, мазь Вилькинсона. Это лечение можно сочетать с дачей гризеофульвина внутрь.

Лишай у кошки что делать, симптомы, лечение и профилактика в домашних условиях

@denya117

О Petstory узнала случайно, когда планировала заводить котят. Читала одну из статей по уходу за питомцем, где была реклама приложения, я скачала и начала изучать функционал. Уже буквально через 20 минут была готова заказывать кошачий ДМС, но не смогла, потому что котятам не было 2-х месяцев. Когда познакомилась с приложением поближе, была приятно удивлена. Очень понравилось, что дежурный терапевт всегда может быть на связи, чтобы решить проблему и сэкономить нервные клетки и деньги на поездку в вет.клинику 😅 Поняла, что очень удобно и выгодно заказывать «План заботы», я заказала и не пожалела! Мне даже не пришлось бегать и искать средства против блох и глистогонное — это все было внутри. Я проконсультировалась о применении средств с дежурным онлайн-ветеринаром и осталась довольна!

@1pankova

Нашла сервис случайно, когда понадобилась срочная ветеринарная консультация, а ветклиники в это время ещё были закрыты. Скачала приложение, и ни разу не пожалела! Нам попался очень хороший врач, который сразу же связался с нами по видеосвязи и подробно проконсультировал, что нужно делать в данной ситуации. «План заботы» оказался для меня также приятной находкой. Теперь я могу не волноваться, если вдруг забываю купить корм Милке, так как набор рассчитан на месяц с учетом возраста и веса питомца. И самое главное — Милка тоже была рада набору, ведь там была для неё игрушка в подарок, а из коробки получился прекрасный домик!🥰

@shanti__kitty

Увидела акцию «План заботы» с 50% скидкой от Petstory. Меня это очень заинтересовало, я как раз хотела перевести своего котёнка на другой корм, но сомневалась. Было забавно, когда я начала заполнять профиль питомца в приложении и выпал именно тот корм, на который я как раз хотела перейти. До этого мы брали Monge, и нам он не подошел, а новый корм нравится больше, но пока наблюдаю за реакцией. От посылки были в полном восторге! Начиная от коробочки и до самого заказа. Очень понравилось, что в посылочку вложили препараты от паразитов, мы как раз делаем прививку и они нам были нужны. Плюс удобный мерный стаканчик и, конечно же, игрушка, которая очень понравилась Шанти.

@vasilekvasik

Меня привлекла акция в 50% на первый заказ «Плана заботы». При этом качество продукта совсем не пострадало! Понравилось, что в наборе есть сухой и влажный корм премиум-класса.Также порадовало, что в коробку кладут ветеринарные средства от паразитов. И очень приятный сюрприз — игрушка для котика. Здорово, что, помимо корма, Petstory дает возможность обращаться за консультацией к онлайн-ветеринару в любое время и в неограниченном количестве.

@davydova_di

Я увидела рекламу Petstory в соц.сетях. Позже мои знакомые рассказали мне, что уже пользовались этим приложением и остались довольны. Мне тоже приложение понравилось, потому что им удобно и легко пользоваться. Можно получить ответы на все свои вопросы про питомца не выходя из дома. Квалифицированные ветеринары помогают сориентироваться в дальнейших действиях.

@shelari.art

Я искала ветеринарную помощь онлайн, потому что мы очень переживали за здоровье, так как это наша первая собака. Подписались, когда Перчик был совсем щенком. Регулярно обращаемся за консультациями и однажды ему даже спасли жизнь. Сейчас уже коробочка превратилась в комфортный образ жизни. Мы просто любим Перчика, а Petstory заботится о нем. Особенный лайк за игрушку — Перчик их обожает! Он пока малыш, ему всего полгода. Перчик удачно сочетает в себе качества кота, зайца и собаки: спит клубочком, скачет по полям, прячется в укромные места и сгрызает бумажные изделия. В коробке от Petstory он одновременно спит и утоляет свои потребности в уничтожении (одна коробочка живёт у нас не больше двух месяцев ). Ещё он любит разбрасывать свои игрушки Джиджит и Гиви, обе они из коробки.

@_valry_

Увидела в инстаграм яркое и красивое объявление с довольной собачьей мордой и захотелось узнать, от чего можно испытывать такое наслаждение:) Перешла по ссылке, скачала приложение и сформировала заказ для своей красотки — мопса Бусинки. Подобрала корм и заказала доставку, приятным бонусом оказалась скидка на первый заказ. Через день уже получили красиво упакованный заказ: препараты для обработки, корм на весь месяц, приятный бонус — игрушку. Самое крутое, что Буся находится под постоянной заботой Petstory: в любое время могу написать ветеринару в приложении и проконсультироваться. А ещё порадовали ветеринарные препараты! Круто, что не выходя из дома, можно заказать своему любимцу все необходимое на целый месяц!

Лишай у домашней кошки: откуда он мог взяться?

Когда ветеринарный врач диагностирует у любимого усатого питомца грибковую инфекцию, владелец часто недоумевает: лишай у домашней кошки откуда мог появиться, если животное не выходит на улицу? Ответом станут знания о путях заражения и мерах профилактики дерматофитии у домашних животных.

Содержание статьи

Причины появления

Лишай представляет собой инфекционное заболевание волосяного и кожного покрова, вызванного патогенными микроорганизмами. Чаще всего возбудителями заболевания являются грибки рода Microsporum. Если специалисты говорят о микроспории или рода Trichophyton, тогда речь идет о трихофитии. По клиническому проявлению, реакции на лекарственные средства оба вида патогенного грибка ведут себя практически одинаково. Поэтому грибковая инфекция, вызванная этими микроорганизмами, чаще носит общее название – стригущий лишай. Зачастую патология наблюдается у молодых особей в возрасте около года. Взрослые кошки болеют редко.

У кошки на носу стригущий лишай

Заражение могут провоцировать ряд факторов:

• травмы и микротравмы кожного покрова;

• неудовлетворительные условия содержания в питомниках, приютах;

• применение иммуносупрессивных препаратов;

Одной из причин, почему у кошек появляется лишай, является низкий иммунитет. Ветеринарные специалисты уже давно отмечают, что здоровые животные с сильной иммунной системой редко болеют грибковой инфекцией.

Заболевание чаще регистрируется в осенне-зимний период. В жарком и влажном климате лишай имеет большее распространение, чем в северных широтах.

К возбудителям микроспории и трихофитии наиболее восприимчивы персидские кошки, у которых практически отсутствует иммунитет к этим видам грибков.

Как происходит заражение

Источником возбудителя лишая у кошек является больное животное. Чаще всего эта инфекция встречается у бродячих, бездомных котов и кошек.

Возбудитель стригущего лишая обладает высокой устойчивостью во внешней среде. Его споры способны сохранять патогенность в течение нескольких лет. Они устойчивы к солнечному свету, температуре. В почве споры грибка сохраняются до 3-х месяцев, поэтому часто попадают в помещение с обувью.

Если домашняя питомица не имеет доступа на улицу, не контактирует с бездомными и бродячими животными, то причину, откуда берется лишай у кошек в этом случае, бывает непросто найти. Для заражения не обязательно иметь прямой контакт с больными особями. Домашняя красавица, никогда не видевшая улицы, вполне может заразиться при контакте с обувью, различными предметами, принесенными в дом. Кроме этого, больной лишаем человек (особенно маленькие дети) является для домашнего питомца источником инфекции.

Не все дезинфицирующие средства способны уничтожить возбудителя. Такая высокая сохранность патогенных микроорганизмов увеличивает риск заражения домашних животных через инфицированные предметы.

Как понять, что питомица заражена

Возбудитель стригущего лишая поражает волосяные луковицы, что сопровождается выпадением волос, появлением перхоти у животного. Участки облысения приобретают округлую или овальную форму, локализуются чаще всего на голове и конечностях. При развитии патологического процесса пораженные участки сливаются, площадь здоровой кожи уменьшается.

Поражение волосяного корня приводит к инфицированию бактериями, что сопровождается воспалительным процессом. При этом может развиваться экссудативный дерматит, гнойное воспаление фолликулов. Пораженная кожа покрывается чешуйками, корочками. На участках облысения наблюдается покраснение. Кожа покрывается пустулами и папулами, образуются струпья.

Заболевание сопровождается зудом. Зараженное животное часто чешется, ведет себя беспокойно. В запущенных случаях кошка теряет аппетит, худеет. Больное животное становится вялым, угнетенным.

Диагностика

Ультрафиолетовое исследование лампой Вуда

Лишай у домашних животных можно спутать с другими заболеваниями: экземой, дерматитом, аллергией. Поэтому животное необходимо отвезти в клинику. Ветеринарный специалист, помимо клинического осмотра, обязательно проведет лабораторные исследования для постановки диагноза. Наиболее часто применяют следующие методы диагностики:

• Облучение пораженных участков ультрафиолетовой лампой. Грибки и продукты их жизнедеятельности при такой манипуляции светятся зеленоватым светом. Данный метод не всегда позволяет выявить трихофитию.

• Исследование пораженного волоса под микроскопом. Грибковые споры при этом определяются в 40 — 70% случаев.

• Длительным, но достоверным методом диагностики стригущего лишая является посев проб биологического материала на питательные среды с последующим определением рода грибков под микроскопом.

В диагностике заболевания важное место имеет именно комплексный подход. Следует также знать, что если в доме проживают другие животные, то даже при отсутствии у них клинических проявлений следует провести комплексную лабораторную диагностику.

Рекомендуем прочитать статью о том, как вылечить насморк и чих кота в домашних условиях. Из нее вы узнаете о причинах чихания у кошки, диагностике, лечении в домашних условиях, профилактических мерах.

Профилактика

Предупредить заражение питомицы стригущим лишаем можно, выполняя ряд рекомендаций:

• Вакцинация. Для иммунизации используют следующие вакцины: “Поливак-ТМ”, “Вакдерм-F”, “Микродерм”. Обработку можно проводить не только взрослым животным, но и котятам начиная с 2-х месячного возраста. Перед вакцинацией обязательно делают обработку против гельминтов. График введения зависит от вида иммунизирующего препарата.

• Ограничение контакта с бездомными и уличными животными.

• Проведение вязок только с клинически здоровыми и провакцинированными представителями породы.

• Соблюдение правил гигиены при использовании предметов по уходу за кошкой.

• Поддержание иммунитета питомца на должном уровне. Сильная иммунная система не позволит развиваться патогенным микроорганизмам.

• Полноценное питание и грамотный уход.

Ответственный владелец, зная, откуда у кошек лишай, сможет оградить домашнего питомца от проникновения возбудителя. Следует помнить, что микроорганизмы, вызывающие грибок, очень стойкие во внешней среде. Для профилактики заболевания следует иммунизировать домашнюю кошку, укреплять иммунитет и ограничивать контакт с бродячими животными.

Похожие статьи

• Чем лечить лишай у кошки, чем мазать и обработать…

  Является причиной сбоя иммунной системы и относится к незаразным формам. … Лишай у домашней кошки: откуда он мог взяться? Лечение выделений из глаз у кошки. Кот постоянно чешется и вылизывается: почему так…

• Кот постоянно чешется и вылизывается: почему так…

  Могут быть причиной того, что кот лижется постоянно. Например, нарушение нормальной работы щитовидной железы, коры … Как определить лишай у кошки, что это такое и как… Лишай у домашней кошки: откуда он мог взяться?

• Почему у кошки выпадает шерсть, сильно лезет клоками…

  Основные причины. Густой и пушистый шерстный покров домашней питомицы – не только индикатор ее физического здоровья, но и предмет гордости заботливого владельца. … Как определить лишай у кошки, что это такое и как…

Самые распространенные кожные заболевания у кошек

Часто у кошек на коже появляются различные покраснения, язвочки, гнойнички, струпья и т.д. Купив какую-либо мазь в аптеке проблему не решить. Ведь кожных заболеваний существует очень много, и к каждому нужно соответствующее лечение, которое может назначить только ветеринарный врач.

Стригущий лишай.

Грибковое заболевание (микроспория) которое развивается в связи с неправильным содержанием питомца, травмами кожи и ослабленным иммунитетом. Грибок повсюду, опасность подстерегает гуляющую кошку на улице, при общении с бродячими питомцами, также от крыс и мышей можно подхватить микроспорию. Кошки, которые живут в доме тоже могут заразиться, владелец приносит на обуви с уличной грязью. У животного которое заразилось микроспорией появляются пятна округлой формы, безволосые. В зависимости от длительности болезни кожа может быть поражена на нескольких участках, чаще в области головы, ушей, лап и хвоста. Там могут образовываться гнойнички и шелушения кожи. Лишай у котов — это достаточно сложное заболевание, которому понадобится длительное время для лечения, его подбирает врач по определенной схеме. Хорошим решением будет сделать вакцинацию питомца и не беспокоится о возможном заражении.

Демодекоз.

Демодекоз – это заболевание, которое вызывает подкожный клещ, он обитает в слоях кожи кошки. Самый распространённый вид клеща это Demodex cati — это незаразная форма клеща, каждая кошка является переносчиком данного вида, но атакует он только тогда, когда у питомца ослабленный иммунитет. Поддаются этому заболеванию некрепкие и ослабившиеся особи, животные, которые подверглись сильному стрессу, после перенесения каких-либо инфекций, при нарушениях обменных процессов, и кошки породы: сиамская, бирманская и т.д.,

Симптомы:

• сильный зуд, кошка расчесывает места поражения;
• видимые покраснения и раздражения кожи;
• облысения, что начинаются с морды, за ушами, и конечностей животного;
• бугорки, которые при надавливании выделяют кровь или гной;
• общее ухудшение состояния питомца.

Самолечением заниматься опасно, поэтому следует обратиться к специалисту, который возьмет соскобы с пораженных участков кожи, чтобы провести исследование под микроскопом. Лечение проходит с помощью мазей, купаний питомца, инъекций и таблеток, которые назначает только врач исходя из степени поражения кожи.

Экзема.

Острое, воспалительное, незаразное заболевание которое развивается в следствии чувствительности кожи к разным факторам. Если животное уже заразилось, то далее будет нелегкий путь к выздоровлению, так как лечение займет длительное время и возможно появление рецидива, а иногда болезнь переходить в хроническую форму, чтобы этого не допустить, следует обратиться к ветеринару.

Экзема имеет множество причин появления, самые распространенные из них:

• ослабленный иммунитет;
• ранее перенесенные заболевания;
• несбалансированное питание по питательным веществам, нехватка жирных кислот и биотина;
• загрязнение кожи, реакция на шампунь;
• трение некачественного ошейника;
• сильные расчёсывания в связи с укусами насекомых.

Также данное заболевание имеет мокнущую форму и сухую, характеризуются они такими симптомами как покраснения кожи, сильный зуд, могут образоваться пузырьки наполненые серой жидкостью, кошка может стать агрессивной, шипеть и царапаться при попытке осмотра кожи.

Лечение экземы назначается после осмотра врача, ни в коем случае не в домашних условиях, нужно учитывать те факты, что экзема имеет несколько разновидностей и различных форм протекания, определить которые сможет только опытный специалист, он составит грамотное лечение и владельцу нужно будет следовать его рекомендациям.

Лишай у домашних животных. Симптомы, признаки, диагностика, лечение лишая у животных

Дерматофития или лишай – это общее название заболеваний, вызываемых патогенными грибами дерматофитами. Они принадлежат к группе организмов, которые способны лизировать кератин тканей, имеющих роговой слой, таких как эпидермис, волосы и когти. В редких случаях дерматофиты способны поражать глубоколежащие ткани, например, при ослабленном иммунитете.

Возбудителями лишая у животных являются несовершенные грибы родов Microsporum, Trichophyton и Epidermophyton. У животных наиболее часто обнаруживаются такие возбудители, как Microsporum canis, Microsporum gypseum, Trichophyton mentagrophytes. Важно помнить, что все они заразны и для человека, однако возникновение заболевания зависит от иммунитета. Даже клинически здоровое животное может являться носителем дерматофитии.

Заражение лишаем у домашних животных происходит при контактах с больными особями, зараженными предметами ухода или окружающей средой. Во внешней среде жизнеспособность спор достигает 12–20 лет и до 5 лет в пораженном волосе.

Стоит отметить, что не у всех животных, которые контактировали со спорами, возникает заболевание. Предрасполагающими факторами являются:

• молодой возраст (до 1 года)
• вирусные инфекции (вирусный лейкоз кошек, вирусный иммунодефицит кошек)
• новообразования
• ятрогенная иммуносупрессия (прием глюкокортикостероидов или циклоспорина)
• неполноценный рацион
• беременность, лактация
• эндокринологические заболевания (гиперадренокортицизм, сахарный диабет)
• нарушение целостности кожного покрова

Признаки лишая у животных могут проявляться совершенно по-разному. Наиболее часто типичная картина проявляется у молодняка. Основные места поражения – мордочка, конечности. Сначала возникают небольшие участки облысения, затем пораженная поверхность кожи начинает шелушиться. Также волосы могут обламываться в нескольких миллиметрах от кожи, поэтому поражение может выглядеть как «бритый» участок. Помимо типичных симптомов лишай у животных может вызывать фолликулит, фурункулез, поражение когтей, керион (округлое новообразование на поверхности кожи), псевдомицетому у персидских кошек, милиарный дерматит, пиодермию.

Дерматофитию нужно дифференцировать от других заболеваний, которые проявляются схожим образом. Особенно это важно при нетипичной клинической картине.

Диагностика должна включать в себя несколько этапов.

Наиболее распространенным методом является исследование Лампой Вуда. При исследовании в темном помещении микроспория дает характерное изумрудное свечение. К сожалению, только 50% штаммов M.Canis дают положительный результат при этом виде диагностики. При местной обработке поражений флуоресценции может не быть. Таким образом, метод не является достаточно достоверным для постановки диагноза, в то же время при наличии флуоресценции диагноз считается подтвержденным.

Следующим методом является исследование пораженных волосков под микроскопом с целью обнаружения спор дерматофитов. Данный метод носит название трихоскопия. Отрицательный результат исследования также не является основанием для исключения лишая.

На данный момент самым достоверным способом исследования является посев на дерматофиты. К недостаткам метода следует отнести длительность исследования. Посев занимает 21 день.
Разработаны тесты для исследования на дерматофитов методом ПЦР, но пока они не получили массового распространения.

При дерматофитозах может происходит самовыздоровление, которое занимает несколько месяцев. У ослабленных, молодых животных и с целью уменьшения сроков выздоровления необходимо проводить лечение.

Лечение лишая у животных заключается в местных обработках и приеме системных препаратов. Существует огромное количество всевозможных противогрибковых средств для местного применения. Нужно учитывать, что одни местные обработки не всегда дают на животных желаемый эффект, хотя их совместное применение с системными препаратами положительно сказывается на результате терапии.

Состригание шерсти не всегда оправдано. Несмотря на то что местные препараты будут лучше воздействовать на очаг поражения, имеется ряд существенных минусов. При удалении шерсти может произойти травмирование кожи и риск развития вторичной микрофлоры, а также разнос инфекции по всему телу.

Назначение системных противогрибковых препаратов делается с учетом физиологического состояния и массы животного. Также необходимо учитывать побочные действия, связанные с применением этих препаратов.

Во время лечения необходимо проводить дезинфекцию в помещениях, где содержатся больные кошки и собаки.

Вакцины признаны неэффективными в борьбе с дерматофитией, поэтому их применение нецелесообразно.
Лечение проводится до получения отрицательного посева на дерматофиты.

В настоящее время данное заболевание поддается лечению, и эвтаназия больных животных больше не проводится, поэтому при подозрении на дерматофитию не впадайте в панику, а своевременно обратитесь к ветеринарному специалисту.

Как уберечься от микроспории | Краевой кожно-венерологический диспансер г. Хабаровска

 

Микроспория(стригущий лишай)

 Микроспория — заразное заболевание покровов, вызываемое специфическими грибками Microsporum canis и Trichophyto tonsurans. Болезнь эта весьма заразна, и наиболее всего ей подвержены дети; стригущий лишай у человека поражает чаще всего кожу и волосы, реже ногти. Если на кожных покровах имеются мелкие повреждения или же у человека снижен иммунитет, то заражение более вероятно.Обычно стригущий лишай у человека возникает вследствие контакта с больным домашним питомцем (кошкой или собакой) или с бродячими животными, которые чаще всего являются переносчиками грибков, вызывающих данное заболевание. Заразиться можно и через непосредственный контакт с заболевшим человеком или же через пользование его предметами личной гигиены. Однако чаще всего стригущий лишай у человека появляется именно из-за попадания на кожу частичек волос или кожных покровов больных людей или животных. Если появился одиночный очаг заболевания, то его распространению по всему телу способствует мытье мочалкой или губкой.С того момента как грибок попал на кожу, волосы или ногти человека и до появления признаков заболевания может пройти от 5 дней до 6 недель. Обычно признаком стригущего лишая является образование на коже круглых или овальных воспаленных пятен, на которых присутствуют корочки или чешуйки. Больной человек может жаловаться на легкий зуд в воспаленной области. Возможно появление только одного небольшого пятна и отсутствие зуда, но, тем не менее, возникший стригущий лишай лечения требует незамедлительного.Если стригущий лишай у человека поражает волосы, то на месте заражения обычно появляется крупный очаг облысения круглой или овальной формы. На этом участке волосы будут обломаны на уровне 4-8 мм, они будто подстрижены лишаем. Именно из-за этого микроспория и получила в народе прозвание «стригущий лишай». Вокруг очага облысения могут возникать мелкие воспаленные пятна, иногда в большом количестве.Осложнение при заражении этой болезнью возможно в редких случаях. Это происходит, если у человека слишком низкий иммунитет, а болезнь не была выявлена вовремя. Признаками патологического развития заболевания являются нагноение высыпаний, повышение температуры тела и воспаление лимфатических узлов. Нельзя допускать появления осложнений такой болезни, как стригущий лишай, необходимо своевременное лечение. Точный диагноз способен поставить только квалифицированный врач-дерматолог при осмотре. Также он может взять образцы зараженной кожи для анализа под микроскопом с целью подтверждения диагноза.

                                     

Как уберечься от микроспории

·  Микроспория — инфекционное заболевание человека и животных, вызываемое микроскопическими грибками.

·  Пораженные грибками чешуйки кожи, обломки волос, шерсти, содержащие жизнеспособные грибки, отпадая с очагом поражения, заражают вещи больного — одежду, головные уборы, постельное белье, предметы обихода (мочалки, щетки, книги, игрушки и др.). Грибки высокоустойчивы к воздействию многих неблагоприятных факторов внешней среды и способны длительное время сохранять патогенность (заразительность).

·  Заражение этими грибковыми заболеваниями может произойти как при непосредственном контакте с больными животными или человеком, так и при соприкосновении с различными объектами внешней среды, зараженными грибками.

·  Большое значение для профилактики грибковых заболеваний (микроспории) имеет не только своевременное и правильное специфическое лечение, но и тщательное соблюдение правил личной гигиены и проведение дезинфекции одежды и белья, помещений и различных предметов обихода, через которые может произойти заражение.

·  Из животных наиболее частым источником заражения микроспорией являются кошки, особенно котята. К сожалению, иногда вместо лечения заболевших животных их часто выбрасывают на улицу. Такое бродячее, бездомное животное становится источником заражения людей, особенно детей.

·  При подозрении на заболевание микроспорией необходимо немедленно обратиться к врачу, аккуратно посещать его и не прекращать лечения без разрешения врача. Неаккуратное и незаконченное лечение может привести к возврату болезни.

·  Для предупреждения заражения микроспорией окружающих необходимо соблюдать определенные правила:

·  Пораженные грибками участки тела необходимо закрывать повязками (голову закрывать шапочкой или косынкой из легкостирающейся ткани).

·  Пользоваться индивидуальными постельными принадлежностями, полотенцами, бельем, одеждой, расческой, мочалкой и другими предметами.

·  Одежду, головные уборы, использованное белье и другие вещи личного обихода больного хранить отдельно от вещей членов семьи.

·  Не посещать до разрешения врача парикмахерскую, баню, душевую, плавательный бассейн и т. п. 

·  По указанию врача своевременно, правильно и систематически проводить обеззараживание вещей, бывших в употреблении больного: белье — кипятить в течение 15 минут в 1–2%-ном мыльно-содовом растворе или проглаживать горячим утюгом, а расчески, игрушки, щетки мыть теплой водой с мылом. 

Изучение удивительного мира лишайников

Назначить в Google Classroom

Лишайники — это симбиотические отношения. Это между водорослями и грибами. Они живут на Земле миллионы лет. Они живут на камнях. Они живут на деревьях. И почва они живут на почве. Они живут в самых разных средах обитания. Они живут на всех семи континентах. Лишайники нас окружают.Но ученые все еще узнают, что они из себя представляют. Они все еще учатся, где живут. И они узнают, сколько существует разных видов лишайников.

Грибок — это любая группа спорообразующих организмов. Питаются органикой. Это касается и форм. В его состав входят дрожжи. В него входят грибы. И это включает поганки. Водоросли — простое растение. Не цветет.

Водоросли содержат хлорофилл. Они производят сахар. Они производят его посредством фотосинтеза.Это похоже на другие растения. Но настоящих стеблей у водорослей нет. У них нет корней. У них нет листьев. И у них нет сосудистой ткани. Такие вещи есть у большинства других растений. Лихенизация — это грибковый образ жизни. Поэтому название лишайника — это название компонента гриба.

Посмотрите на лишайник. Вы смотрите на «домик», где вместе растут грибок и водоросль. Ученые называют этот дом «слоевищем». Встречаются водоросли и грибок. И они образуют этот дом.Затем мы видим лишайник. Это партнерство называется симбиотическими отношениями. Это потому, что он помогает выжить и грибам, и водорослям. Исследования показали, что лишайники не являются естественной биологической группой. Это означает, что не все они происходят от одного общего предка. Это означает, что у лишайников разное происхождение. В настоящее время известно почти 20 000 видов лишайниковых грибов.

Грибок и водоросли выигрывают от связи друг с другом. Это происходит в этих симбиотических отношениях.Грибок обеспечивает дом. Его убежище. Также называется слоевищем. Это убежище помогает водорослям выжить. Он выживает в местах обитания, где в противном случае был бы подвержен воздействию элементов. Вероятно, он не мог выжить. Водоросли служат пищей для грибка. Это в виде сахара. Сахар — это побочный продукт. Это происходит из-за фотосинтеза. Это происходит внутри водорослей.

Лишайники очень важны для окружающей среды. Они являются важным источником пищи. Это для многих животных.Они предоставляют птицам материал для гнезд. Они обеспечивают среду обитания и материал для биомимикрии. Это для насекомых. Это также и для других организмов.

Лишайники также важны для человека. Они содержат натуральные красители. Они предоставляют духи. Они предоставляют лакмусовую бумажку. И даже дают еду. Люди используют лишайники как биоиндикаторы. Это организмы, которые помогают людям следить за здоровьем окружающей среды. Некоторые виды лишайников чувствительны к загрязнению окружающей среды. Их присутствие или отсутствие может помочь нам лучше понять здоровье окружающей среды.Один из примеров — качество воздуха.

Лишайники производят более тысячи различных химических соединений. Большинство из них уникальны для лишайников. Эти соединения включают кислоты. И в их состав входят пигменты. Некоторые химические вещества могут даже флуоресцировать под УФ-светом. Это делает их важными компонентами для идентификации лишайников.

У лишайников есть ДНК. Используется для выявления лишайников. Он также используется для сравнения взаимоотношений между видами и внутри них. Анализ ДНК был важным инструментом.Его используют лихенологи. Это помогает им идентифицировать и понимать биоразнообразие лишайников.

Настройтесь на бесплатную интернет-трансляцию Smithsonian Science How. Он называется «Что такое лишайник? Как ученый из Смитсоновского института изучает уникальный симбиоз». Вы встретитесь с доктором Мануэлой Даль Форно. Интернет-трансляция состоится в четверг, 14 ноября. Вы сможете увидеть ее в 11:00 и 14:00 по восточному стандартному времени. Вы можете смотреть видео в прямом эфире. Будут интерактивные опросы. И есть вопросы и ответы. Ману ответит на вопросы о лишайниках и ее исследованиях.Зарегистрируйтесь и настройтесь здесь: https://naturalhistory.si.edu/education/distance-learning/what-is-lichen-symbiosis

Получите рабочий лист учащегося для веб-трансляции. Получите руководство для учителя для интернет-трансляции.

Исходный URL: https://www.tweentribune.com/article/junior/exploring-amazing-world-lichens/

границ | Полногеномное секвенирование с помощью дробовика обнаруживает большее грибковое разнообразие лишайников, чем методы на основе ампликонов в образцах окружающей среды

Введение

Микробное разнообразие, присутствующее в окружающей среде, все больше признается за его важную и разнообразную роль в здоровье экосистем (Chen et al., 2018; Ноттингем и др., 2018; Pike et al., 2018), особенно в условиях меняющегося климата (Cavicchioli et al., 2019). Неудивительно, что большое внимание было уделено количественной оценке биоразнообразия — количества, идентичности и функций видов (Gotelli and Colwell, 2001; Faith, 2002; Barlow et al., 2007). Это также помогло исследователям более полно задокументировать ареалы редких или исчезающих видов с помощью стратегий обнаружения ДНК в окружающей среде (Olson et al., 2012; Thomsen et al., 2012; Spear et al., 2015). Дальнейшее расширение воздействия этой относительно новой области, микробная метагеномика оказалась исключительно полезной для информирования стратегий восстановления нарушенных местообитаний, таких как экологически чувствительные биологические корки почвы (BSC; Bowker, 2007; Steven et al., 2012). Неспособность полностью понять микробное (биотическое) сообщество, таким образом, может резко ограничить понимание того, что структурирует экологические взаимодействия, распределение видов и экологическую устойчивость, что, в свою очередь, может негативно повлиять на принятие обоснованных решений по сохранению (Guisan et al., 2013).

Повышенная доступность и доступность высокопроизводительного секвенирования способствовала широкомасштабному изучению структуры микробного сообщества (Logares et al., 2012, 2014; Chen et al., 2017; Zhang et al., 2018). В настоящее время в большинстве широкомасштабных оценок биотического разнообразия используется преимущественно независимое от культуры секвенирование на основе ампликонов (Petrosino et al., 2009; Mande et al., 2012; Uyaguari-Diaz et al., 2016). Этот метод основан на достаточно вариабельных, универсально присутствующих областях генома или «локусах штрих-кодирования» (Hebert and Gregory, 2005; Kress and Erickson, 2008).Такие локусы должны, прежде всего, быть достаточно уникальными, чтобы различать виды, присутствующие в выборке (Kolbert et al., 2004). Распространение биоинформатических конвейеров, разработанных для секвенирования штрих-кода, привело к широкому распространению возможностей для анализа микробного разнообразия и структуры сообществ, присутствующих в самых разных средах, от почвы до человеческого тела (например, QIIME; Caporaso et al., 2010; Kuczynski et al. др., 2012; Навас-Молина и др., 2013). Эти конвейеры полагаются в первую очередь на ген 16S рибосомной ДНК (рДНК) как мишень для амплификации ПЦР и последующего секвенирования для различения видов (Winker and Woese, 1991; Kolbert et al., 2004; Петросино и др., 2009). Однако недостатки таких основанных на ампликонах подходов включают в себя систематическую ошибку амплификации от умеренной до крайней (Acinas et al., 2005; Wang and Qian, 2009), что позволяет эффективно исследовать только часть общего разнообразия насаждений.

Грибы разлагают органический мусор (Chapin et al., 2002; Osono, 2007), производят вторичные соединения огромной важности для человека, такие как антибиотики (Keller et al., 2005), широко используются в производстве продуктов питания (например, хлеб, вино , пиво; Campbell-Platt and Cook, 1989), и являются обычными сельскохозяйственными вредителями (например,g., Sclerotinia sclerotiorum ; Amselem et al., 2011). Несмотря на огромное экологическое (Bever et al., 2001; Pitt and Hocking, 2009; Van Der Heijden and Horton, 2009) и экономическое значение (Sharma, 1989), метагеномике грибов в целом уделялось меньше внимания по сравнению с метагеномикой бактерий. . Например, только 360 биопроектов NCBI были заархивированы для грибов с использованием молекулярных штрих-кодов на основе ампликонов по сравнению с 5,121 биопроектами, доступными для исследований микробов с использованием молекулярных штрих-кодов на основе ампликонов (поиск, проведенный 21 июня 2019 года в архиве биопроектов NCBI).

Лишайники представляют собой богатое видами и эволюционно гетерогенное сообщество грибов, которые образуют облигатные симбиозы с минимум одним основным фотосинтетическим партнером, часто в дополнение к другим эндолихеническим грибам, водорослям и бактериям (Ahmadjian and Jacobs, 1981; Seaward, 1997; Brodo и др., 2001; Папази и др., 2015). Лишайники очень успешны и экологически важны, о чем свидетельствует их обилие и разнообразие в наземных экосистемах по всему миру (Hawksworth, 1991). Наряду с мохообразными, цианобактериями и нелихенизированными грибами лишайники являются важнейшим компонентом биологических сообществ почвенной корки и играют важную роль в процессах экологического восстановления (Belnap, 2001; Belnap and Lange, 2001; Thompson et al., 2006; Боукер, 2007). В дополнение к их решающему экологическому вкладу в такие сообщества лишайниковые грибы имеют относительно небольшие размеры метагенома (Armaleo, May, 2009; Tripp et al., 2017), что делает их идеальными целями для рентабельных проектов в области геномики (Allen et al., 2018). ; Brigham et al., 2018; Funk et al., 2018; Погода и др., 2018, 2019). Учитывая вышесказанное, лишайники служат отличной системой для изучения факторов, сдерживающих установление и развитие облигатных симбиозов в природе, в том числе преобладающих среди сообществ почвенной коры.Такие факторы охватывают динамику распространения пропагул, распространение и создание отдельных симбионтов в окружающей среде, а также биотические взаимодействия между существующими симбионтами в данной среде. На сегодняшний день, однако, мало исследований посвящено таким направлениям исследований, но они полностью основаны на методах секвенирования на основе ампликонов (Banchi et al., 2018; Eaton et al., 2018; см., Например, Tripp et al., 2017; Pizarro et al., 2019).

Эта нехватка геномных ресурсов грибов в целом и геномных ресурсов лишайников в частности затрудняет исследование ключевых вопросов экологии, эволюции, генетики и физиологии лишайников.Более того, существующие исследования, в которых изучались метагеномные сообщества грибов, таких как бактерии, в основном полагались на подходы, основанные на использовании ампликонов. Учитывая известные осложнения, возникающие из-за систематической ошибки амплификации (Acinas et al., 2005; Wang and Qian, 2009), одним из возможных решений является отказ от амплификации локусов штрих-кодирования и использование вместо этого данных полногеномного секвенирования с дробовиком (WGS). Этот метод позволяет избежать классических ошибок амплификации ПЦР, но до настоящего времени он мало использовался, вероятно, из-за одной или нескольких проблем.Помимо увеличения затрат на WGS по сравнению с методами на основе ампликонов, отсутствие разработанных общедоступных баз данных (например, полных или почти полных комплексов рДНК), а также нехватка конвейеров биоинформатики ограничивают полезность WGS в качестве основного инструмент, с помощью которого можно подойти к метагеномным исследованиям грибков и других микробов.

В этом исследовании мы создаем и затем используем новую базу данных рДНК, охватывающую 273 вида лишайниковых грибов, созданную на основе метагеномного исследования лишайников в горячей точке биоразнообразия южных Аппалачских гор, которая характеризуется резкими абиотическими градиентами и является домом для более тысячи виды лишайников (Dey, 1978; Brodo et al., 2001; Ходкинсон, 2010; Лендемер и др., 2013; Трипп и Лендемер, 2019а, б; Tripp et al., В печати). Наряду с разработкой нового биоинформатического конвейера, мы идентифицируем симбионтов лишайниковых грибов, присутствующих в метагеномных образцах окружающей среды WGS, а затем сравниваем эффективность нашего подхода с традиционным секвенированием ампликонов тех же образцов на основе ITS1. Мы помещаем наши результаты в более широкую структуру интенсивной инвентаризации биоразнообразия лишайников на тех же участках, с которых были взяты образцы окружающей среды.Опираясь на полученные данные, мы демонстрируем, что обнаружение симбионтов с использованием безампликоновых методов, здесь WGS, обнаруживает больше видов, чем методы на основе ампликонов. Мы вводим новую метрику биоразнообразия, «Потенциал разнообразия» (далее PoD), которая относится к возможности появления видов на данном участке в данной области исследования, независимо от того, действительно ли вид присутствует на этом участке, как определено традиционная таксономическая инвентаризация. В настоящем исследовании PoD конкретно относится к соотношению симбионтов лишайниковых грибов, обнаруженных на голых поверхностях в окружающей среде, которые будут служить биотическими партнерами в последующем симбиозе лишайников (т.е., потенциальные лишайники, которые могут встречаться на исследуемой делянке, в зависимости от наличия необходимого грибкового симбионта). В этом контексте PoD — полезный показатель, позволяющий полностью учесть биотические ограничения, которые ограничивают формирование облигатных симбиотических организмов. Мы сравниваем этот показатель с количеством лишайников, обнаруженных как установленные симбиозы (т. Е. Лишайников, которые явно встречаются на участке, далее «TD» для таксономического разнообразия).

Материалы и методы

Район исследования, полевые участки и полевой отбор

Это исследование проводилось на двух участках площадью один гектар, расположенных в национальном парке Грейт-Смоки-Маунтинс, в южной точке биоразнообразия гор Аппалачи в восточной части Северной Америки (рис. 1).Участки были выбраны таким образом, чтобы охватить два крайних значения: резкий высотный (один высокий, один низкий) и экологический (низинные твердые породы против облачных лесов с преобладанием хвойных пород) в регионе, чтобы максимизировать разницу в существующих сообществах лишайников. (т. е. минимизировать перекрытие), а также потенциальных экологических пулов симбионтов между участками. Участок с большой высотой (2014 м) располагался на вершине Clingman’s Dome в елово-еловом лесу на границе округа Суэйн, Северная Каролина, и округа Севьер, штат Теннесси.Участок с низкой высотой (670 м) находился в Уайт-Оук-Бранч в смешанном лесу лиственных пород над северным берегом озера Фонтана в округе Суэйн, Северная Каролина.

Рисунок 1 . Сюжетная карта. Область, заштрихованная светло-зеленым цветом (A) , соответствует национальному парку Грейт-Смоки-Маунтинс. Уайт Оук Бранч — это участок для отбора проб на низкой высоте, на высоте 670 м, а Купол Клингмана, самая высокая вершина в Теннесси, находится на высоте 2014 м. (B) .

До отбора проб окружающей среды данные, относящиеся к нескольким экологическим переменным (например,g., DBH деревьев, инвентаризация древесных растений, оценка качества среды обитания, согласно Tripp et al., 2019) были зарегистрированы с целью разграничения растительных сообществ и обеспечения максимальной разницы в сообществах лишайников (см. выше). Оба участка были разграничены так, чтобы они были однородными по типу растительности в пределах участка (т. Е. Не охватывали более одного экотона). На каждом участке была проведена полная инвентаризация видов лишайников [проведена JL, ваучеры депонированы в гербариях Ботанического сада Нью-Йорка [Нью-Йорк] и Университета Колорадо в Боулдере [COLO]]; методы, следующие (Tripp et al., 2019). На каждом участке было получено 16 проб окружающей среды путем протирания поверхностей восьми камней и восьми деревьев (всего 32 пробы окружающей среды) в течение 30 секунд стерильной зубной щеткой (размер, аспект и идентификация были записаны для каждого типа камня и дерева. ; дополнительную информацию см. ниже). Чтобы избежать пробоотбора поверхностей с искусственно завышенным количеством пропагул, таких как отложения спор вдоль русел рек и болот, мы выбрали только вертикально ориентированные, голые поверхности скал и деревьев (т.е., без каких-либо видимых наростов, кроме коры дерева, если применимо).

Коллекция слоевищ

Чтобы упростить прямое сравнение секвенирования на основе ампликонов с секвенированием на основе WGS 32 образцов окружающей среды, мы сначала получили образцы ваучера лишайников для видов, присутствующих в Южных Аппалачах (Таблица S1) в рамках общесистемного исследования факторов биоразнообразие лишайников и их распространение в регионе, включая потенциальные биотические ограничения (e.g., наличие симбионтов), таких как исследованные здесь. Эти образцы были собраны для создания новой базы данных геномных ссылок для лишайников в этом регионе (см. Ниже). Образцы были собраны и идентифицированы JCL и EAT в период с декабря 2016 г. по январь 2018 г. Все ваучерные образцы лишайников депонированы в Нью-Йорке и COLO (Таблица S1). Были предприняты попытки взять образцы только отдельных слоевищ как для макро-, так и для микролишайников. Для макролишайников ок. Удаляли слоевище размером 1 × 1 см, поражая края и доли.В случае микролишайников слоевище соскребали с субстратов камней или деревьев с помощью стерильного бритвенного лезвия. Образцы сушили на воздухе в вытяжном шкафу с ламинарным потоком в течение 24 часов, затем замораживали при -20 ° C до транспортировки в Университет Колорадо для экстракции ДНК и последующего секвенирования.

Схема отбора проб для метагеномики

Для количественной оценки количества и идентификации лихенизированных грибов, присутствующих в 32 образцах окружающей среды, а также для оценки различий между подходами к секвенированию на основе ампликона и WGS, мы собрали образцы с восьми скальных пород и восьми поверхностей деревьев в пределах каждого гектара ( n = 16 на участок).Субстраты были случайно взяты из имеющихся, и были выбраны только голые поверхности без видимых слоевищ мохообразных или лишайников. Стандартизованные трафареты размером 10 × 10 см помещали на подложку и использовали индивидуально упакованную стерильную зубную щетку для протирки поверхности в течение 30 с. Затем зубная щетка, содержащая образец, была запечатана в стерильный пластиковый пакет. Для обработки образцов пакет открывали, щетинки отрезали от кисти стерильным лезвием и стерильными ножницами вырезали отверстие в углу пакета.Открытый угол мешка помещали в стерильную микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл, и щетинки переносили непосредственно в пробирку. Эти образцы хранили при -20 ° C до транспортировки в Университет Колорадо для последующей экстракции и секвенирования.

Извлечение ДНК и секвенирование всего генома с помощью дробовика

Как для 32 образцов окружающей среды, так и для видов лишайников, подтвержденных для создания новой эталонной геномной базы данных, высушенные образцы измельчали ​​в порошок с использованием подшипников из карбида вольфрама в 96-луночном шейкере для планшетов Qiagen.Геномную ДНК (гДНК) экстрагировали из образцов слоевища лишайников и щетинок зубной щетки с использованием набора для растений Qiagen DNeasy 96. Индивидуальные образцы переносили из микроцентрифужных пробирок объемом 1,5 мл в 96-луночные планшеты, используемые в наборе Qiagen. Протокол производителя был изменен, чтобы включить 10-минутную стадию инкубации при 65 ° C для измельченного материала в буфере для лизиса, а также промывку 100% этанолом перед окончательной сушкой мембраны перед элюированием. Предварительное исследование показало, что эти модификации улучшили концентрацию и чистоту гДНК лишайников (Pogoda et al., 2018). Извлеченные образцы хранили при -20 ° C до последующего приготовления библиотеки.

Полногеномное секвенирование было проведено в общей сложности на 494 библиотеках слоевищ лишайников [они собраны по всей исследуемой области южных Аппалачей (рис. S1)] и 32 образцах окружающей среды на Illumina NextSeq ^® . Каждый из образцов гДНК был приготовлен с использованием набора для подготовки библиотеки ДНК Nextera ^® XT, который оптимизирован для 1 нг общей введенной ДНК. Каждый образец был уникально помечен с помощью адаптеров с двойным индексом, Nextera ^® i5 и i7.Библиотеки, подготовленные для секвенирования на NextSeq ^® , использовали Illumina PhiX v.3 в качестве контроля, а образцы, прошедшие QC, были обработаны для считывания парных концов 151 пары оснований на секвенаторе Illumina NextSeq ^® в Институте BioFrontiers Университета Колорадо ( Боулдер, Колорадо).

Секвенирование ITS1

Для сравнения результатов секвенирования на основе WGS с секвенированием на основе ампликонов амплификация с помощью ПЦР была выполнена на 32 образцах окружающей среды с использованием ITS1-F (5′-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA) (Gardes and Bruns, 1993) и ITS2 (5′-GCTGCGTTCTTCATCGATGC ) (White et al., 1990) праймеры. Библиотеки были подготовлены для секвенирования на MiSeq ^® с использованием Illumina PhiX v.3 в качестве контроля. Затем образцы, прошедшие контроль качества, были обработаны для считывания 251 пары оснований с одного конца на секвенаторе Illumina MiSeq ^® в Центре секвенирования и анализа геномики Техасского университета (Остин, Техас).

Сборка генома и справочная геномная база данных

Библиотеки были отфильтрованы с помощью Trimmomatic-0.36 для обрезки адаптеров на основе считываний и с параметрами «LEADING: 3 TRAILING: 3 MINLEN: 100» (Bolger et al., 2014). Затем отфильтрованные чтения были собраны с использованием SPAdes 3.9.0 с параметрами «–careful -k 21,33,65,81» (Bankevich et al., 2012). В этом исследовании использовались целые комплексы ядерной рибосомной ДНК (рДНК), которые были получены из сборки генома de novo лишайников, которые были собраны в рамках более широкого исследования разнообразия лишайников в южной области исследования Аппалачей (Keepers et al., Unpub . данные). Комплекс рДНК легко собирается из-за большого числа копий в ядерном геноме и является длинным (т.е.е.,> 5000 п.н., по сравнению с секвенированием ITS1 на основе ампликонов, которое составляет <500 п.н.), обеспечивая более крупную цель, на которую могут картироваться секвенированные чтения. Более того, высококопийная природа локуса дает множество возможностей для подсчета каждого отростка в последующих анализах. Комплексы рДНК для каждого образца были идентифицированы путем проведения BLAST-поиска комплекса рДНК фотобионта Trebouxioid водорослей из Cladonia uncialis против каждой из сборок. В поисках использовалась рДНК водорослей, а не последовательность микобионтов, чтобы избежать смещения в длине совпадения BLAST из-за филогенетического сходства.Чтобы идентифицировать полные или в основном полные комплексы рДНК из таблиц BLAST, контиги должны были иметь два или более различных совпадений, а диапазон этих совпадений должен был быть длиной> 1000 п.н. Последовательности были проанализированы из сборок на основе положений нуклеотидов попаданий BLAST и ориентированы с 18S в 5′-направлении.

Филогенетические методы

Каждый предполагаемый контиг рДНК, проанализированный из сборок, был проверен методом BLAST в неизбыточной базе данных NCBI.Любые последовательности, лучшие результаты BLAST которых были сопоставлены с нелихенизированными грибами или с негрибковыми видами, были исключены. Чтобы дополнительно проверить идентичность контигов в базе данных, последовательности были выровнены с использованием выравнивателя MUSCLE v3.8.31 (Edgar, 2004) для последующего филогенетического анализа. Результирующее предварительное выравнивание было обрезано, чтобы содержать только высокогомологичные области, затем дополнительно обрезано только до участков, для которых> 90% таксонов в наборе данных содержали данные о последовательностях. Филогенетическое дерево наилучшей оценки было выведено в рамках модели GTR + I + Γ с использованием MrBayes (Huelsenbeck and Ronquist, 2001; Ronquist and Huelsenbeck, 2003) с 10 000 000 поколений MCMC и пробелами, рассматриваемыми как отсутствующие данные.Первые 25% деревьев были признаны выгорающими и исключены из дальнейшего анализа; Выполнено восемь прогонов и задействовано 32 цепи. Для всех остальных параметров были оставлены значения по умолчанию, а к концу анализа среднее стандартное отклонение разделенных частот стало меньше рекомендованного 0,01. Деревья из апостериорного распределения использовались для создания дерева консенсуса большинства, на котором мы отображали апостериорные вероятности.

Это предварительное дерево консенсуса было визуализировано с помощью FigTree v.1.4.3, на основании которого мы определили, что 34 образца, вероятно, были неуместны из-за несогласия с установленными крупномасштабными филогенными реконструкциями лихенизированных грибов (например, Miadlikowska et al., 2014). Таким образом, эти 34 образца были исключены из выравнивания, которое затем было дополнительно удалено от дублированных последовательностей таксона, так что окончательная матрица содержала только одного представителя от каждого вида (и в каждом случае сохранялся самый длинный контиг рДНК). Полученное окончательное выравнивание включало в общей сложности 273 последовательности и после визуального осмотра с использованием тех же филогенетических методов, описанных выше, использовалось в качестве эталонной базы данных для последующих запросов последовательностей, полученных в результате секвенирования образцов окружающей среды.

Чтение отображения

Считывания ампликона размером 251 п.н. были усечены до 151 п.н., чтобы гарантировать сопоставимость последовательностей на основе ампликонов с последовательностями WGS. Чтобы исключить области последовательности праймеров ПЦР, считывания ампликонов были усечены, чтобы включить только положения 50–200, представляющие сильно вариабельную последовательность ITS1. Последовательности как из WGS, так и из подходов на основе ампликонов были затем выровнены с недавно созданной базой данных эталонной рДНК для создания карт выравнивания для короткого чтения. Чтобы гарантировать, что чтения однозначно сопоставлены с одним локусом в базе данных, было использовано несколько шагов фильтрации.Во-первых, были сохранены только те чтения, которые сопоставлены с оценкой CIGAR от 145 до 151 совпадений, что соответствует идентичности сопоставления от 96 до 100%. Во-вторых, были сохранены только пары чтения, для которых левое и правое чтение отображено в один и тот же контиг, а затем только пары чтения, для которых оба чтения отображены с качеством отображения SAM 31 или выше (из максимум 60) были сохранены. Из-за высококонсервативной природы частей кодирующих областей комплекса рибосомальной ДНК многие считывания, принадлежащие видам, для которых несколько конгенеров были представлены в базе данных, почти одинаково хорошо сопоставлены с несколькими видами.В этих случаях оценка сопоставления поддерживалась расчетным разделением чтения. Таким образом, требуется более высокий балл SAM CIGAR, составляющий 150 или 151, для сохранения считываний, которые также хорошо картируются с представителем того же рода.

Кривые накопления видов

Для облегчения сравнения видового разнообразия и накопления, оцененных по образцам окружающей среды, кривые разрежения видового богатства для каждого из 32 образцов, подпадающих под четыре режима отбора образцов (т. Е. По восемь в каждом из высокогорных пород, высокогорных деревьев, низких горных пород, низких высотных отметок). tree) были созданы с помощью калькулятора Diversity Stats в EstimateS 9.1.0 (Colwell, 2013). Кривые разрежения были загружены путем 100-кратной рандомизации порядка образцов.

Сравнение методов отбора проб окружающей среды и экспертной инвентаризации

Для оценки соответствия между двумя метагеномными методами (т. Е. WGS и ампликон) обнаружения симбионтов в образцах окружающей среды (потенциал разнообразия или «PoD»), а также соответствия обоих методов инвентаризации на основе экспертов (Coddington et al. ., 1991; Sørensen et al., 2012) видов, обнаруженных на каждом участке (таксономическое разнообразие, или «TD»), мы объединили таксоны, обнаруженные во всех образцах, собранных в каждом из четырех режимов отбора образцов (высокие скалы, высокие деревья , низкая скала, невысокое дерево), чтобы составить единый список видов, обнаруженных с помощью данного метода) и рассчитал индексы Жаккара для каждой инвентаризации.Они были получены из матрицы присутствия / отсутствия, которая состояла из видов, присутствующих в справочной базе данных рДНК, которые были обнаружены на каждой из двух крайних высот с помощью (1) экспертной инвентаризации биоразнообразия лишайников, (2) лихенизированных грибов, обнаруженных в образцы окружающей среды с использованием секвенирования на основе ампликонов и (3) лихенизированные грибы, обнаруженные в образцах окружающей среды с использованием секвенирования WGS. Сходство между лишайниками, обнаруженными разными методами, указано ниже как J _{Treatment, Treatment} (e.g., J _{WGS, Vouchered} — это сходство лихенизированных грибов, обнаруженных WGS в пробах окружающей среды, с грибами, обнаруженными при инвентаризации на основе экспертов).

Результаты

База данных рибосомальной ДНК

Окончательная эталонная геномная база данных рДНК лишайников содержала полные или почти полные комплексы рибосомной ДНК (NTS, ETS, 18S, ITS1, 5.8S, ITS2, 26 / 28S) для 273 уникальных видов лихенизированных грибов в пределах Pezizomycotina, представляющих 25 порядков и 57 семьи. База данных охватывала 1 770 139 п.н. последовательности со средней длиной контига 6 484 п.н.

Обнаружение лихенизированных грибов с использованием инвентаризации экспертов, WGS и ампликонов

Таксономическое разнообразие (TD: количество подтвержденных видов) лишайников, растущих на исследуемых участках, насчитывало 57 видов на высокогорном участке и 83 вида на низком участке, в результате чего получилось 136 видов на обоих участках ( n = 4 вида встречались в обоих). Из этих 136 видов 78 (~ 60%) были представлены в базе данных рДНК, созданной в этом исследовании, и, таким образом, потенциально могли быть сопоставлены с последовательностями из образцов окружающей среды.Обратите внимание, что дополнительные виды в базе данных были зарегистрированы с других участков в исследуемой области и использовались, чтобы установить, обнаружены ли этим методом виды, которые не были зарегистрированы в полевой инвентаризации на основе экспертов.

Картирование считываний парных концов WGS в справочной базе данных рДНК привело к обнаружению в общей сложности 94 лишайниковых грибов, присутствующих на обоих участках: 43 вида с участка с высокой высотой и 71 с участка с низкой высотой (Таблица 1). И наоборот, использование традиционного подхода на основе ампликонов для картирования считываний ITS1 в эталонной базе данных рДНК привело к обнаружению в общей сложности 34 лишайниковых грибов, присутствующих на обоих участках: 21 вид с участка с высокой высотой и 18 видов с участка с низкой высотой. участок (таблица 1).Обнаружение видов накапливалось последовательно быстрее с помощью выборки с использованием WGS во всех четырех режимах выборки (рис. 2). Из 57 видов, зарегистрированных во время инвентаризации высокогорного участка, 13 были обнаружены с использованием обоих методов секвенирования, хотя только семь из этих видов представляли одинаковые видов между двумя участками (Рисунок 3; Таблица 1). Напротив, из 83 видов, которые были зарегистрированы во время инвентаризации участка с низкой высотой, 17 были обнаружены с использованием любого метода секвенирования, хотя только 4 были обнаружены обоими (Рисунок 3; Таблица 1).

Таблица 1 . Инвентаризация видов лихенизированных грибов, собранных на высокогорных участках Clingman’s Dome и низменных участках White Oak Branch.

Рисунок 2 . Загрузочные кривые разрежения для накопления видов лихенизированных грибов, сравнение подхода рДНК на основе WGS (светло-серые полосы) и подхода ITS1 на основе ампликонов (темно-серые полосы) в четырех режимах выборки на двух участках: (A) высотные образцы горных пород; (B) образцов горных пород малых высот; (C) образцов высотных деревьев; (D) образец низкорослого дерева (ось абсцисс: количество образцов окружающей среды; ось ординат: количество обнаруженных видов лихенизированных грибов).Во всех четырех режимах выборки подход на основе WGS, разработанный в этом исследовании, выявил большее видовое разнообразие, чем подход на основе ампликонов.

Рисунок 3 . Диаграммы Венна, сравнивающие количество видов лихенизированных грибов, обнаруженных на участке (A), , невысокий участок Белого Дуба, и (B), , на высотной вершине Купола Клингмана. Диаграммы показывают общее низкое перекрытие обнаруженных видов с использованием подхода WGS (PoD), подхода ампликона (PoD) и подхода к инвентаризации на основе экспертов (TD).

Сходство между сообществом лишайников, произрастающих на участках с помощью экспертной инвентаризации, с пулами видов лишайниковых грибов-симбионтов, обнаруженных в образцах окружающей среды с помощью WGS или секвенирования ампликонов, представлено в виде индексов Жаккара в таблице 2. Значения сходства для скопления лихенизированных грибов, обнаруженные в окружающей среде на высокогорном участке, по сравнению с теми, которые зарегистрированы в экспертной инвентаризации (J _{WGS, Vouchered} = 0,148, J _{AMP, Vouchered} = 0.200) были примерно в два раза выше, чем их соответствующие индексы на участке с низкой высотой (J _{WGS, Vouchered} = 0,108, J _{AMP, Vouchered} = 0,063). Этот результат передает большее соответствие между инвентаризацией PoD на основе секвенирования WGS и инвентаризацией TD, чем инвентаризацией PoD, основанной на секвенировании ампликонов, с инвентаризацией TD.

Таблица 2 . Сравнение соответствия между видами, обнаруженными любым методом, и зарегистрированными видами на каждом участке.

Обсуждение

Наши результаты показывают, что, по сравнению с секвенированием ампликонов, подход WGS обнаруживает большее количество видов, которые существуют в окружающей среде в качестве пропагул. При анализе в тандеме с данными экспертной таксономической инвентаризации тех же мест, появляется дополнительная возможность сравнивать количество и состав сообществ существующих, полностью сформированных симбиозов, которые встречаются в природе, с теми, которые потенциально могут иметь место на основе пула. симбионтов в окружающей среде.В свою очередь, это сравнение PoD-to-TD помогает распутать биотические ограничения на распределение биоразнообразия. Оценка количества видов и таксономического разнообразия с использованием секвенирования метагенома WGS была концептуально подтверждена в сообществах планктонных микробов (Poretsky et al., 2014). Однако, насколько нам известно, применение этого метода к макроэукариотам только начинается (Donovan et al., 2018). Это исследование обеспечивает существенное увеличение количества последовательностей рДНК из лихенизированных грибов, которые теперь доступны для будущих исследований.На момент написания (апрель 2019 г.) в Pezizomycotina было 779 полных (> 3000 п.н.) последовательностей рибосомной ДНК (если при поиске требуется «18S», «полный» и «26S» или «28S») общедоступно в GenBank. С учетом 49 полных последовательностей рибосомных ДНК лихенизированных грибов, которые уже были отправлены из базы данных, созданной здесь, наши дополнительные 224 новые последовательности представляют собой 29% -ное увеличение геномных ресурсов этого локуса для лишайников.

Представленный здесь рабочий процесс дополняет растущий набор инструментов молекулярного вклада в науку о биоразнообразии.Мы продемонстрировали полезность использования метагеномных библиотек WGS для оценки пула доступных симбионтов, присутствующих в окружающей среде. Учитывая ожидаемое продолжающееся снижение стоимости секвенирования (Schuster, 2007), мы ожидаем, что WGS будет легко адаптирован во многих исследовательских системах и организмах.

Распространение лишайников и их черенков

На обоих участках отбора проб (на большой и низкой отметке) виды были обнаружены на основе отбора проб окружающей среды (PoD), которых не было на основе отбора проб TD.Другими словами, микобионты лишайников были обнаружены в пробах окружающей среды, но не были обнаружены при инвентаризации лишайников, произрастающих на участке. У этих результатов есть два правдоподобных объяснения. Во-первых, и это, вероятно, применимо к большинству таких случаев, виды, обнаруженные в пробах окружающей среды, но не в инвентаризации, присутствовали только в виде пропагул, полученных из других мест. Было показано, что гаметы лишайников, размножающихся половым путем, могут распространяться на несколько километров (Ronnås et al., 2017), и даже клональные пропагулы способны распространяться на расстояние более километра (Gjerde et al., 2015; Eaton et al., 2018), хотя эти исследования показывают, что такие случаи распространения на большие расстояния редки по сравнению с общими репродуктивными пропагулами. выход любого данного индивидуального слоевища лишайников. Таким образом, неудивительно, что банк отростков лишайников на данной поверхности может включать представителей более разнообразного пула видов лишайников, происходящих из более широкого географического района, независимо от пригодности субстрата для колонизации этими видами.Действительно, аналогичные закономерности были получены при секвенировании ампликонов пропагул лишайников из образцов домашней пыли в США (Tripp et al., 2016).

Наличие одного только лихенизированного ростка гриба представляет собой только один элемент всего биотического сообщества, необходимого для того, чтобы один вид лишайника вырастал в зрелую особь, с наличием или отсутствием других видов водорослей, бактерий и / или других грибов, потенциально представляющих ограничения для развитие данного слоевища лишайников (см. Tripp et al., 2019). Другие ограничения включают абиотические факторы, такие как режимы высот или осадков, выбранные разными видами лишайников. Одним из примеров этого явления в нашем наборе данных является Bulbothrix scortella , который был обнаружен только при WGS-секвенировании образцов окружающей среды с высокогорного участка. Bulbothrix scortella — субтропический вид, который встречается только на низких высотах в южных Аппалачах (Hale, 1976; Lendemer et al., 2013). Таким образом, обнаружение видов с помощью только секвенирования WGS, вероятно, отражает распространение лихенизированных грибковых пропагул на высокогорье (из близлежащих низинных местообитаний), где они вряд ли приживутся и будут развиваться дальше из-за абиотических факторов. и / или биотические ограничения.

Второе и менее вероятное объяснение наших результатов — это неспособность обнаружить присутствие лишайника с помощью экспертных TD-инвентаризаций. Лишайники широко признаны специалистами по микропредприятию, многие виды представлены в виде небольших или пространственно ограниченных популяций в данном географическом районе (Peck et al., 2004; Belinchón et al., 2015; Boch et al., 2016; Dymytrova et al., 2016). ). Примеры из нашей собственной работы показали, что в некоторых случаях инвентаризация одной и той же территории более чем одним сборщиком дает перекрытие <50% в когортах задокументированных видов (Lendemer et al., 2016). В настоящем исследовании Loxospora elatina — это вид, распространение которого ограничено бореальными лесами умеренного пояса (то есть высокогорными средами обитания в южных Аппалачских горах) в Северной Америке и Европе (Tønsberg, 1992; Lendemer, 2013). Этот вид был обнаружен обоими методами секвенирования на высокогорном участке, но не обнаружен в инвентаре TD. Таким образом, возможно, что в ограниченном числе случаев виды, обнаруженные в пробах окружающей среды, но не в инвентаризациях TD, присутствовали в низкой численности и не были обнаружены.Однако наша экспертная инвентаризация для более широкого исследовательского проекта, под который подпадает текущее исследование (т. Е. Изучение факторов разнообразия и распределения лишайников в южных Аппалачских горах), нацелена на исчерпывающий отбор проб до тех пор, пока не будет проведена полная проверка всего пула видового разнообразия. выполнено (Tripp et al., 2019).

Хотя повторный отбор образцов дополнительных участков с высокой и низкой высотой не проводился в этом исследовании, мы, тем не менее, обнаружили явные различия в когортах видов между двумя экстремумами высот со всеми использованными здесь методами.На высоких и низких высотах в южных Аппалачах обитают разные сообщества лишайников, которые имеют общее лишь небольшое количество видов (Lendemer, Tripp, 2008, Allen and Lendemer, 2016; Muscavitch, Lendemer, 2016; Lendemer et al., 2017; Tripp, Lendemer, 2019a, b; Tripp et al., 2019). Таким образом, следует ожидать различий между инвентарными запасами двух участков. Некоторые различия в когортах видов, обнаруженных посредством отбора проб окружающей среды, могут отражать общее ограничение распространения пропагул лишайников, что приводит к тому, что в пуле пропагул доминируют местные виды.Мы предполагаем, что на больших высотах можно было бы ожидать обнаружения меньшего количества событий «рассредоточения на большие расстояния», таких как описано для B. scortella выше, по сравнению с более низкими высотами. На способность пропагул к распространению частично влияет сила тяжести (Ronnås et al., 2017), и, таким образом, пропагулам предстоит нелегкая битва при распространении вверх за счет пассивного рассеивания ветром.

Преимущества и ограничения WGS по сравнению с секвенированием ампликонов

Наш анализ выявил примерно в четыре раза больше видов с использованием подхода WGS по сравнению с методом на основе ампликонов на участке с низкой высотой и в два раза больше на участке с высокой высотой.Большее количество видов, обнаруженных WGS, обеспечивает более строгий порог для того, что считается обнаруженным видом в файле SAM (например, путем подсчета обнаруженных видов только в том случае, если они встречаются по крайней мере определенное количество раз в файле SAM, или путем требования более высокий балл качества картографирования SAM перед подсчетом обнаруженных видов).

Сообщество, присутствующее в образце метагеномики, содержит ДНК видов, которые в одних случаях представлены множеством клеток, а в других — потенциально одной клеткой.Такие резкие различия в количестве вводимых от разных видов в образце приводят к потенциальным проблемам как для WGS, так и для методов секвенирования ампликонов в окружающей среде. В то время как оба метода основаны на том, что ДНК с низким содержанием ДНК экстрагируется в достаточном количестве и качестве для обнаружения в последующем анализе, метагеномика на основе ампликонов страдает от трудностей с дизайном праймеров, включая проблемы с использованием универсальных праймеров (Acinas et al., 2005; Wang и Qian, 2009). Более того, неравномерная (смещенная) амплификация вызывает серьезную озабоченность в связи с искажением распределения ампликонов в продукте ПЦР (Acinas et al., 2005; Сипос и др., 2010). И наоборот, одна потенциальная проблема с метагеномикой WGS заключается в том, что для видов с низкой численностью в образце вероятность выборки этого вида из подготовленной библиотеки будет масштабироваться обратно пропорционально пропорции секвенированной подготовленной библиотеки. По этим причинам когорты видов, обнаруженных в сообществе, могут отличаться от минимальных до значительных между двумя методами.

Одним из осложнений нашего подхода является наличие интронов группы I (DePriest, Been, 1992; DePriest, 1993; Gargas et al., 1995) в кодирующих последовательностях (18S, 5.8S и 28S) многих рибосомных комплексов лишайниковых грибов. Эти интроны могут переноситься горизонтально между видами (Hibbett, 1996; Fitzpatrick, 2012; Roy and Irimia, 2012). Таким образом, возможно, что чтение, исходящее от интрона группы I в комплексе рДНК вида, которого нет в нашем наборе данных, может отображаться в базе данных для вида, который недавно получил горизонтальный перенос этого интрона. Однако это будет происходить очень редко и тем более по мере улучшения базы данных по нескольким причинам.Во-первых, наша эвристика для фильтрации чтения довольно строгая, требуя, чтобы пары чтения однозначно отображались с высоким процентом идентичности с членами базы данных. Если интрон не был перенесен совсем недавно, быстрая эволюция таких интронов (Dujon, 1989; Gargas et al., 1995; Roy and Irimia, 2012) предотвратила бы ложное обнаружение вида в базе данных. Более того, эти интроны могут способствовать более высокому уровню обнаружения видов из-за их быстрой эволюции по сравнению с кодирующими областями, которые во многих случаях слишком консервативны, чтобы однозначно идентифицировать виды.

Двигаясь вперед, мы стремимся реализовать представленный здесь подход для измерения соответствия между наблюдаемой TD лишайников в южных Аппалачах и PoD, измеренной в банке пропагул, как один шаг вперед в понимании потенциальных биотических ограничений на распределение биоразнообразия лишайников. . Экологические ковариаты, которые предсказывают это совпадение, могут позволить разработать экономически эффективные меры по сохранению в экологически чувствительных ключевых системах, таких как биологические корки почвы (Eldridge, 2000; Belnap, 2003; Belnap and Lange, 2013).Мы предлагаем, чтобы представленный здесь метод WGS был добавлен к набору инструментов, используемых молекулярными систематиками в стремлении к сохранению и восстановлению, в дополнение к облегчению более общего понимания того, какие структуры распределения видов. Представленные здесь наборы данных и биоинформатические ресурсы представляют собой важный набор новых инструментов и подходов, которые можно использовать для решения широкого круга вопросов.

Заявление о доступности данных

База данных, состоящая из полных (или почти полных) комплексов рибосомной ДНК 273 микобионтов лишайников, доступна по адресу Zenodo record # 3256645.Библиотеки метагеномики WGS и ампликона опубликованы в базе данных SRA, SUB5873533.

Авторские взносы

KK провел исследование, проанализировал данные и интерпретировал их. KK, CP, ET и JL написали статью. ET, JL, CM и NK разработали концепцию проекта и обеспечили финансирование и управление им. JL, ET, KK, KW, CA и JH собрали и распределили образцы. Обработка, курирование и архивирование ваучерных образцов и полевых данных осуществлялось AR. KK, KW, CP и CA выполнили извлечение и подготовку библиотеки.NK участвовал в разработке пайплайна биоинформатики и редактировал статью.

Финансирование

Эта работа была поддержана грантом Программы измерения биоразнообразия Национального научного фонда [награда № 1542639 [Университет Колорадо] и награда № 1432629 [Ботанический сад Нью-Йорка]], а также награды IGERT № 1144807 Национального научного фонда за программа IQBiology в Институте BioFrontiers Университета Колорадо.

Конфликт интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

Мы благодарим рецензентов за конструктивные улучшения этой рукописи. Публикация этой статьи финансировалась Фондом открытого доступа к библиотекам Боулдера Университета Колорадо.

Дополнительные материалы

Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fevo.2019.00484/full#supplementary-material

Рисунок S1. Область исследования южных Аппалачей охватывает штаты Алабама, Джорджия, Теннесси, Южная Каролина, Северная Каролина, Вирджиния и Западная Вирджиния.

Список литературы

Ацинас, С. Г., Сарма-Рупавтарм, Р., Клепак-Церадж, В., и Польз, М. Ф. (2005). Артефакты и систематическая ошибка последовательности, индуцированные ПЦР: выводы из сравнения двух библиотек клонов 16S рРНК, построенных из одного и того же образца. Заявл. Environ. Microbiol. 71, 8966–8969. DOI: 10.1128 / AEM.71.12.8966-8969.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ахмаджян В. и Джейкобс Дж. Б. (1981). Связь грибка и водоросли в лишайнике Cladonia cristatella tuck. Природа 289, 169–172. DOI: 10.1038 / 289169a0

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Аллен, Дж. Л., и Лендемер, Дж. К. (2016). Изменение климата влияет на эндемичные высотные лишайники в очаге биоразнообразия. Biodivers. Консерв. 25, 555–568. DOI: 10.1007 / s10531-016-1071-4

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Аллен, Дж. Л., Маккензи, С. К., Слейт, Р. С., и Альтер, С. Е. (2018). Первый полногеномный анализ эндемичного лишайника Cetradonia linearis, находящегося под угрозой исчезновения, выявил изоляцию из-за удаленности и сильную популяционную структуру. Am. J. Bot. 105, 1556–1567. DOI: 10.1101 / 237164

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Амселем, Дж., Куомо, К. А., Ван Кан, Дж. А., Виуд, М., Бенито, Э. П., Кулу, А. и др. (2011). Геномный анализ некротрофных грибковых патогенов Sclerotinia sclerotiorum и Botrytis cinerea . PLoS Genet. 7: e1002230. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1002230

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Армалео, Д., и Мэй, С. (2009). Определение размеров геномов грибов и водорослей лишайника Cladonia grayi с помощью количественной ПЦР. Симбиоз 49:43. DOI: 10.1007 / s13199-009-0012-3

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Banchi, E., Ametrano, C.G., Stanković, D., Verardo, P., Moretti, O., Gabrielli, F., et al. (2018). Метабаркодирование ДНК раскрывает грибковое разнообразие смешанных образцов, переносимых по воздуху в Италии. PLoS ONE 13: e0194489. DOI: 10.1371 / journal.pone.0194489

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Банкевич, А., Нурк, С., Антипов, Д., Гуревич, А.А., Дворкин, М., Куликов, А.С. и др. (2012). SPAdes: новый алгоритм сборки генома и его приложения для секвенирования отдельных клеток. J. Comp. Биол. 19, 455–477. DOI: 10.1089 / cmb.2012.0021

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Барлоу Дж., Гарднер Т. А., Араухо И. С., Авила-Пирес Т. К., Боналдо А. Б., Коста Дж. Э. и др. (2007). Количественная оценка ценности биоразнообразия первичных, вторичных и плантационных тропических лесов. Proc. Natl. Акад. Sci. США 104, 18555–18560. DOI: 10.1073 / pnas.0703333104

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белинчон Р., Яр Р. и Эллис К. Дж. (2015). Взаимодействие между видами с контрастирующими способами распространения объясняет распространение эпифитных лишайников. Экография 38, 762–768. DOI: 10.1111 / ecog.01258

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белнап, Дж. (2001). «Сравнительная структура физических и биологических почвенных корок» в Биологические почвенные корки: структура, функции и управление (Берлин, Гейдельберг: Springer) 177–191.DOI: 10.1007 / 978-3-642-56475-8_15

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белнап, Дж. (2003). Мир у ваших ног: биологические корки почвы пустыни. Фронт. Ecol. Environ. 1, 181–189. DOI: 10.1890 / 1540-9295 (2003) 001 [0181: TWAYFD] 2.0.CO; 2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белнап Дж. И Ланге О. Л. (2001). «Структура и функционирование биологических почвенных корок: синтез», в «Биологические почвенные корки: структура, функции и управление» (Нью-Йорк, Нью-Йорк; Берлин; Гейдельберг: Springer), 471–479.DOI: 10.1007 / 978-3-642-56475-8_33

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белнап Дж. И Ланге О. Л. (ред.). (2013). Биологические почвенные корки: структура, функции и управление, Vol. 150. Springer Science & Business Media.

Google Scholar

Бевер Дж. Д., Шульц П. А., Прингл А. и Мортон Дж. Б. (2001). Арбускулярные микоризные грибы: более разнообразны, чем кажется на первый взгляд, и экологическая история того, почему: высокое разнообразие экологически различных видов арбускулярных микоризных грибов в пределах одного сообщества имеет широкое значение для экологии растений. AIBS Bull. 51, 923–931. DOI: 10.1641 / 0006-3568 (2001) 051 [0923: AMFMDT] 2.0.CO; 2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бох С., Прати Д., Шёнинг И. и Фишер М. (2016). Богатство видов лишайников является самым высоким на неинтенсивно используемых пастбищах, что способствует созданию подходящих микропредприятий и низкой конкуренции со стороны сосудистых растений. Biodivers. Консерв. 25, 225–238. DOI: 10.1007 / s10531-015-1037-y

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Боукер, М.А. (2007). Биологическая реабилитация почвенной корки в теории и на практике: малоиспользуемые возможности. Рестор. Ecol. 15, 13–23. DOI: 10.1111 / j.1526-100X.2006.00185.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бригам, Л. М., Альенде, Л. М., Шипли, Б. Р., Бойд, К. К., Хиггинс, Т. Дж., Келли, Н. и др. (2018). Геномное понимание митохондрий 11 восточно-североамериканских видов Cladonia. Митохондриальная ДНК, часть B 3, 508–512. DOI: 10.1080 / 23802359.2018.1463827

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бродо, И. М., Шарнофф, С. Д., и Шарнофф, С. (2001). Лишайники Северной Америки . Новый рай; Лондон: Издательство Йельского университета.

Google Scholar

Кэмпбелл-Платт Г. и Кук П. Э. (1989). Грибы при производстве продуктов питания и пищевых ингредиентов. J. Appl. Бактериол. 67, 117с − 131с. DOI: 10.1111 / j.1365-2672.1989.tb03776.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Капорасо, Дж.G., Kuczynski, J., Stombaugh, J., Bittinger, K., Bushman, F. D., Costello, E. K., et al. (2010). QIIME позволяет анализировать данные секвенирования сообщества с высокой пропускной способностью. Nat. Методы 7: 335. DOI: 10.1038 / nmeth.f.303

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кавиккиоли Р., Риппл В. Дж., Тиммис К. Н., Азам Ф., Баккен Л. Р., Бейлис М. и др. (2019). Предупреждение ученых человечеству: микроорганизмы и изменение климата. Nat. Rev. Microbiol. 1: 569–86. DOI: 10.1038 / s41579-019-0222-5

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чапин Ф. С., Матсон П. А. и Муни Х. А. (2002). Разложение Земли . Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Springer New York, 151–175.

Google Scholar

Чен, В., Пан, Ю., Ю, Л., Ян, Дж., И Чжан, В. (2017). Закономерности и процессы в биогеографии морских микроэукариотических сообществ в прибрежных водах Сямыня и приливных отложениях, юго-восток Китая. Фронт. Microbiol. 8: 1912. DOI: 10.3389 / fmicb.2017.01912

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чен, З. М., Чанг, В. Х., Чжэн, А. Дж., Чжан, С., Цай, Х. Ю. и Лю, Г. Х. (2018). Сравнение микробного разнообразия кишечника у цыплят пекинских масличных и древесных кур. Ред. Бразилия. Ciênc. Avícol. 20, 37–44. DOI: 10.1590 / 1806-9061-2017-0549

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Коддингтон, Дж. А., Грисволд, К.Э., Сильва Давила, Д., Пенаранда, Э. и Ларчер, С. Ф. (1991). «Разработка и тестирование протоколов отбора проб для оценки биоразнообразия в тропических экосистемах», в The Unity of Evolutionary Biology: Proceedings of the Fourth International Congress of Systematic and Evolutionary Biology , ed EC Dudley (Portland, OR: Dioscorides Press), 44–60 .

Google Scholar

DePriest, P. T., and Been, M. D. (1992). Многочисленные интроны группы I с вариабельным распределением в рибосомной ДНК лишайникового гриба. J. Mol. Биол. 228, 315–321. DOI: 10.1016 / 0022-2836 (92)

-6

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Дей, Дж. П. (1978). Фрутико-листовые лишайники высокогорных районов южных Аппалачей. Бриолог 81, 1–93. DOI: 10.2307 / 3242271

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Донован, П. Д., Гонсалес, Г., Хиггинс, Д. Г., Батлер, Г., и Ито, К. (2018). Идентификация грибов в наборах данных метагеномики дробовика. PLoS ONE 13: e0192898. DOI: 10.1371 / journal.pone.0192898

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Димитрова, Л., Стофер, С., Гинзлер, К., Брейнер, Ф. Т., и Шайдеггер, К. (2016). Данные о структуре лесов улучшают модели распределения специалистов по местообитаниям, находящимся под угрозой: значение для сохранения эпифитных лишайников в лесных ландшафтах. Biol. Консерв. 196, 31–38. DOI: 10.1016 / j.biocon.2016.01.030

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Итон, С., Zuniga, C., Czyzewski, J., Ellis, C.J., Genney, D., Haydon, D., et al. (2018). Метод прямого обнаружения распространения в лишайниках по воздуху. Мол. Ecol. Ресурс. 18, 240–250. DOI: 10.1111 / 1755-0998.12731

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Элдридж Д. (2000). Экология и управление биологическими почвенными корками: последние события и будущие проблемы. Бриолог 103, 742–747. DOI: 10.1639 / 0007-2745 (2000) 103 [0742: EAMOBS] 2.0.CO; 2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вера, Д. П. (2002). Количественная оценка биоразнообразия: филогенетическая перспектива. Консерв. Биол. 16, 248–252. DOI: 10.1046 / j.1523-1739.2002.00503.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Функ, Э. Р., Адамс, А. Н., Споттен, С. М., Ван Хов, Р. А., Уиттингтон, К. Т., Хранители, К. Г. и др. (2018). Полные митохондриальные геномы пяти лишайниковых грибов рода Usnea (Ascomycota: Parmeliaceae). Митохондриальная ДНК, часть B 3, 305–308. DOI: 10.1080 / 23802359.2018.1445485

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гардес, М., и Брунс, Т. Д. (1993). Праймеры ITS с повышенной специфичностью для базидиомицетов — применение для выявления микоризы и ржавчины. Мол. Ecol. 2, 113–118. DOI: 10.1111 / j.1365-294X.1993.tb00005.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гаргас А., ДеПрайст П. Т. и Тейлор Дж.W. (1995). Положение множественных вставок в рДНК SSU лишайниковых грибов. Мол. Биол. Evol. 12, 208–218.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Гьерде И., Блом, Х. Х., Хегаард Э. и Сётерсдаль М. (2015). Модели колонизации лишайников показывают незначительное влияние расстояния распространения в ландшафтном масштабе. Экография 38, 939–948. DOI: 10.1111 / ecog.01047

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Готелли, Н. Дж., И Колвелл, Р.К. (2001). Количественная оценка биоразнообразия: процедуры и подводные камни измерения и сравнения видового богатства. Ecol. Lett. 4, 379–391. DOI: 10.1046 / j.1461-0248.2001.00230.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Guisan, A., Tingley, R., Baumgartner, J. B., Naujokaitis-Lewis, I., Sutcliffe, P. R., Tulloch, A. I., et al. (2013). Прогнозирование распределения видов для принятия решений по сохранению. Ecol. Lett. 16, 1424–1435. DOI: 10.1111 / ele.12189

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хейл, М.Э. младший (1976). Монография о лишайнике рода Bulbothrix Hale (Parmeliaceae). Smithsonian Contrib. Бот . 32, 1–29. DOI: 10.5479 / si.0081024X.32

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хоксворт, Д. Л. (1991). Грибковый аспект биоразнообразия: масштабы, значение и сохранение. Mycol. Res. 95, 641–655. DOI: 10.1016 / S0953-7562 (09) 80810-1

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хиббетт, Д. С. (1996). Филогенетические доказательства горизонтальной передачи интронов группы I в ядерной рибосомной ДНК грибовидных грибов. Мол. Биол. Evol. 13, 903–917. DOI: 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025658

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ходкинсон, Б. П. (2010). Первая оценка разнообразия лишайников для одной из «горячих точек» биоразнообразия Северной Америки в южных Аппалачах в Вирджинии. Castanea 75, 126–133. DOI: 10.2179 / 09-033.1

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Huelsenbeck, J. P., and Ronquist, F. (2001). MRBAYES: байесовский вывод филогении. Биоинформатика 17, 754–755. DOI: 10.1093 / биоинформатика / 17.8.754

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Келлер, Н. П., Тернер, Г., Беннет, Дж. У. (2005). Вторичный метаболизм грибов — от биохимии к геномике. Nat. Rev. Microbiol. 3: 937. DOI: 10.1038 / nrmicro1286

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Колберт, К. П., Рис, П. Н., Хопкинс, М., Линч, Д. Т., Гермер, Дж. Дж., О’Салливан, К. Э. и др. (2004). «Анализ последовательности ДНК 16S рибосом для идентификации бактерий в лаборатории клинической микробиологии» в Молекулярная микробиология: диагностические принципы и практика (Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press), 361–377.

Google Scholar

Кучински Дж., Стомбо Дж., Уолтерс В. А., Гонсалес А., Капорасо Дж. Г. и Найт Р. (2012). Использование QIIME для анализа последовательностей гена 16S рРНК из микробных сообществ. Curr. Протоколы Microbiol. 27, 1E − 5. DOI: 10.1002 / 9780471729259.mc01e05s27

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лендемер, Дж. К. (2013). Два новых бесплодных вида локсоспор (Sarrameanaceae: Lichenized Ascomycetes) со среднеатлантической прибрежной равнины. J. North Carol. Акад. Sci. 129, 71–81. DOI: 10.7572 / 2167-5880-129.3.71

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лендемер, Дж. К., Андерсон Стюарт, К. Р., Бесал, Б., Голдсмит, Дж., Гриффит, Х., Хоффман, Дж. Р. и др. (2017). Лишайники и родственные им грибы государственного парка Маунт-Митчелл, Северная Каролина: первый контрольный список с исчерпывающими ключами и сравнением с историческими данными. Castanea 82, 69–97. DOI: 10.2179 / 17-126

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лендемер, Дж.К., Харрис, Р. К., и Руис, А. М. (2016). Обзор лишайников смелого очага биологического разнообразия в среднеатлантической прибрежной равнине Северной Каролины, восточной части Северной Америки. Castanea 81, 1–77. DOI: 10.2179 / 15-073R2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лендемер, Дж. К., Харрис, Р. К., и Трипп, Э. А. (2013). Лишайники и родственные им грибы национального парка Грейт-Смоки-Маунтинс. Mem. Н. Ю. Ботан. Сад 104, 1–152.

Google Scholar

Лендемер, Дж.К. и Трипп Е. А. (2008). Вклады в флору лишайников Северной Каролины: предварительный контрольный список лишайников государственного парка Гордж. Бриолог 111, 57–67. DOI: 10.1639 / 0007-2745 (2008) 111 [57: CTTLFO] 2.0.CO; 2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Логарес Р., Хаверкамп Т. Х., Кумар С., Лансен А., Недербрагт А. Дж., Айва К. и др. (2012). Экологическая микробиология через призму высокопроизводительного секвенирования ДНК: синопсис современных платформ и подходов к биоинформатике. J. Microbiol. Методы 91, 106–113. DOI: 10.1016 / j.mimet.2012.07.017

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Логарес, Р., Сунагава, С., Салазар, Г., Корнехо-Кастильо, Ф. М., Феррера, И., Сарменто, Х. и др. (2014). Метагеномные метки 16S рДНК Illumina — мощная альтернатива секвенированию ампликонов для изучения разнообразия и структуры микробных сообществ. Environ. Microbiol. 16, 2659–2671. DOI: 10.1111 / 1462-2920.12250

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Манде, С.С., Мохаммед, М. Х., Гош, Т. С. (2012). Классификация метагеномных последовательностей: методы и проблемы. Краткое. Биоинформатика 13, 669–681. DOI: 10.1093 / bib / bbs054

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Miadlikowska, J., Kauff, F., Högnabba, F., Oliver, J.C., Molnár, K., Fraker, E., et al. (2014). Мультигенный филогенетический синтез класса Lecanoromycetes (Ascomycota): 1307 грибов, представляющих 1139 внутриродовых таксонов, 317 родов и 66 семейств. Мол. Филогенет. Evol. 79, 132–168. DOI: 10.1016 / j.ympev.2014.04.003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мускавич, З. М., и Лендемер, Дж. К. (2016). Новый вид Acanthothecis (Ostropales) подчеркивает субтропические флористические элементы биоты лишайников южных Аппалачей в восточной части Северной Америки. Бриолог 119, 350–360. DOI: 10.1639 / 0007-2745-119.4.350

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Навас-Молина, Дж.А., Перальта-Санчес, Дж. М., Гонсалес, А., Мак-Мерди, П. Дж., Васкес-Баеза, Ю., Сюй, З. и др. (2013). «Улучшение нашего понимания микробиома человека с помощью QIIME», в Methods in Enzymology, Vol 531 (Cambridge, MA: Academic Press), 371–444. DOI: 10.1016 / B978-0-12-407863-5.00019-8

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Nottingham, A. T., Fierer, N., Turner, B. L., Whitaker, J., Ostle, N.J., McNamara, N.P., et al. (2018). Микробы следуют примеру Гумбольдта: температура влияет на микробное разнообразие растений и почвы от Амазонки до Анд. Экология 99, 2455–2466. DOI: 10.1002 / ecy.2482

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Олсон, З. Х., Бригглер, Дж. Т., и Уильямс, Р. Н. (2012). Подход eDNA для обнаружения восточных хеллбендеров (Cryptobranchus a. Alleganiensis) с использованием образцов воды. Wildlife Res. 39, 629–636. DOI: 10.1071 / WR12114

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Осоно, Т. (2007). Экология лигнинолитических грибов, связанных с разложением листового опада. Ecol. Res. 22, 955–974. DOI: 10.1007 / s11284-007-0390-z

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Папази, А., Кастанаки, Э., Пиринтсос, С., и Котзабасис, К. (2015). Симбиоз лишайников: природные высокопроизводительные машины для индуцированного производства водорода. PLoS ONE 10: e0121325. DOI: 10.1371 / journal.pone.0121325

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пек Дж. Э., Грабнер Дж., Лэдд Д. и Ларсен Д. Р. (2004).Родство лишайников в Миссури Озарк с микроместообитанием. Бриолог 107, 47–61. DOI: 10.1639 / 0007-2745 (2004) 107 [47: MAOMOL] 2.0.CO; 2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Петрозино, Дж. Ф., Горец, С., Луна, Р. А., Гиббс, Р. А., и Версалович, Дж. (2009). Метагеномное пиросеквенирование и идентификация микробов. Clin. Chem. 55, 856–866. DOI: 10.1373 / Clinchem.2008.107565

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Питт, Дж.И., Хокинг А. Д. (2009). «Экология грибковой порчи пищевых продуктов» в Fungi and Food Spoilage (Бостон, Массачусетс: Springer), 3–9. DOI: 10.1007 / 978-0-387-92207-2_2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Писарро Д., Даль Гранде Ф., Ливит С. Д., Дайер П. С., Шмитт И., Креспо А. и др. (2019). Данные о последовательности всего генома раскрывают широко распространенный гетероталлизм в самой большой группе грибов, образующих лишайник. Genome Biol. Evol. 11, 721–730. DOI: 10.1093 / GBE / evz027

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Погода, с.С., Хранители, К. Г., Лендемер, Дж. К., Кейн, Н. К. и Трипп, Е. А. (2018). Снижение сложности митохондриальных геномов у лишайниковых грибов проливает свет на архитектуру генома облигатных симбиозов. Мол. Ecol. 27, 1155–1169. DOI: 10.1111 / mec.14519

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Pogoda, C. S., Keepers, K. G., Nadiadi, A. Y., Bailey, D. W., Lendemer, J. C., Tripp, E. A., et al. (2019). Оптимизация генома за счет полной потери интронов происходила многократно в митохондриях лихенизированных грибов. Ecol. Evol. 9, 4245–4263. DOI: 10.1002 / ece3.5056

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Порецкий Р., Родригес -Р. Л. М., Луо, К., Цеменци, Д., Константинидис, К. Т. (2014). Сильные и слабые стороны секвенирования ампликона гена 16S рРНК для выявления временной динамики микробного сообщества. PLoS ONE 9: e93827. DOI: 10.1371 / journal.pone.0093827

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Роннос, К., Werth, S., Ronnås, C., Werth, S., Ovaskainen, O., Varkonyi, G., et al. (2017). Обнаружение распространения гамет на большие расстояния у аскомицета, образующего лишайник. Новый фитолог 216, 216–226. DOI: 10.1111 / nph.14714

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Seaward, M. R. D. (1997). Основное влияние лишайников на процессы биоразрушения. Внутр. Биодетериор. Биодегр. 40, 269–273. DOI: 10.1016 / S0964-8305 (97) 00056-5

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Шарма, Х.С. (1989). Хозяйственное значение теплолюбивых грибов. Заявл. Microbiol. Biotechnol. 31, 1–10. DOI: 10.1007 / BF00252517

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сипос Р., Секели А., Ревес С. и Мариалигети К. (2010). Устранение ошибок ПЦР в исследованиях микробиологии окружающей среды. Methods Mol. Биол. 599, 37–58. DOI: 10.1007 / 978-1-60761-439-5_3

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Соренсен, Л. Л., Коддингтон, Дж. А., и Шарф, Н. (2012). Инвентаризация и оценка разнообразия пауков подкопий с использованием методов полуколичественной выборки в афромонтанном лесу. Pest Manage. Sampl. 31, 319–330. DOI: 10.1603 / 0046-225X-31.2.319

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Спир, С. Ф., Гровс, Дж. Д., Уильямс, Л. А., и Уэйтс, Л. П. (2015). Использование методов ДНК окружающей среды для улучшения обнаруживаемости в программе мониторинга хеллбендера (Cryptobranchus alleganiensis). Biol. Консерв. 183, 38–45. DOI: 10.1016 / j.biocon.2014.11.016

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Стивен Б., Гальегос-Грейвс Л. В., Старкенбург С. Р., Чейн П. С. и Куске К. Р. (2012). Целенаправленный и дробный метагеномный подходы позволяют по-разному описывать микробные сообщества почв засушливых земель в ходе полевого исследования с манипуляциями. Environ. Microbiol. Rep. 4, 248–256. DOI: 10.1111 / j.1758-2229.2012.00328.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Томпсон, В.А., Элдридж Д. Дж. И Бонсер С. П. (2006). Структура биологических сообществ почвенной коры в лесных массивах Callitris glaucophylla в Новом Южном Уэльсе, Австралия. J. Veg. Sci. 17, 271–280. DOI: 10.1111 / j.1654-1103.2006.tb02446.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Томсен, П. Ф., Килгаст, Дж., Иверсен, Л. Л., Мёллер, П. Р., Расмуссен, М., и Виллерслев, Э. (2012). Обнаружение разнообразной морской фауны рыб с использованием ДНК окружающей среды из проб морской воды. PLoS ONE 7: e41732.DOI: 10.1371 / journal.pone.0041732

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Тёнсберг, Т. (1992). Средиальные и исидиальные, кортиковые, корковые лишайники в Норвегии. Sommerfeltia 14, 1–331.

Google Scholar

Трипп, Э.А., и Лендемер, Дж. К. (2019a). Основные моменты 10-летнего лихенологического исследования в национальном парке Грейт-Смоки-Маунтинс: празднование столетия Службы национальных парков США. Syst.Бот. 44, 943–980. DOI: 10.1600 / 036364419X15710776741332

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Трипп, Э.А., и Лендемер, Дж. К. (2019b). Полевой путеводитель по лишайникам национального парка Грейт-Смоки-Маунтинс . Теннесси: Университет Теннесси Пресс, Ноксвилл.

Google Scholar

Трипп, Э.А., Лендемер, Дж. К., Барберан, А., Данн, Р. Р., Фирер, Н. (2016). Градиенты биоразнообразия в облигатных симбиотических организмах: изучение разнообразия и особенностей пропагул лишайников в Соединенных Штатах. J. Biogeogr. 43, 1667–1678. DOI: 10.1111 / jbi.12746

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Трипп, Э.А., Лендемер, Дж. К., и Маккейн, К. М. (2019). Качество среды обитания и нарушения определяют богатство видов лишайников в умеренной зоне биоразнообразия. Oecologia 190, 445–457. DOI: 10.1007 / s00442-019-04413-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Трипп, Э.А., Чжуан, Ю., Лендемер, Дж. К. (2017). Обзор существующих данных по полному геному позволяет предположить, что мицелий лишайника может быть гаплоидным или диплоидным. Бриолог 120, 302–310. DOI: 10.1639 / 0007-2745-120.3.302

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Уягуари-Диас, М. И., Чан, М., Чабан, Б. Л., Кроксен, М. А., Финке, Дж. Ф., Хилл, Дж. Э. и др. (2016). Комплексный метод на основе ампликонов и метагеномной характеристики вирусов, бактерий и эукариот в пробах пресной воды. Микробиом 4:20. DOI: 10.1186 / s40168-016-0166-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван дер Хейден, М.Г. и Хортон Т. Р. (2009). Социализм в почве? Важность микоризных грибковых сетей для содействия естественным экосистемам. J. Ecol. 97, 1139–1150. DOI: 10.1111 / j.1365-2745.2009.01570.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван, Ю., и Цянь, П. Ю. (2009). Консервативные фрагменты бактериальных генов 16S рРНК и дизайн праймеров для ампликонов 16S рибосомной ДНК в метагеномных исследованиях. PLoS ONE 4: e7401. DOI: 10.1371 / journal.pone.0007401

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Белый, Т.Дж., Брунс, Т., Ли, С. Дж. У. Т. и Тейлор, Дж. У. (1990). Амплификация и прямое секвенирование генов рибосомных РНК грибов для филогенетики. PCR Protoc. 18, 315–322. DOI: 10.1016 / B978-0-12-372180-8.50042-1

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Винкер, С., и Вёзе, К. Р. (1991). Определение доменов Archaea, Bacteria и Eucarya с точки зрения характеристик малой субъединицы рибосомной РНК. Syst. Прил. Microbiol. 14, 305–310. DOI: 10.1016 / S0723-2020 (11) 80303-6

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Zhang, W., Pan, Y., Yang, J., Chen, H., Holohan, B., Vaudrey, J., et al. (2018). Разнообразие и биогеография многочисленных и редких морских микроэукариот в приливной зоне объясняются ограничениями окружающей среды и расселения. Environ. Microbiol. 20, 462–476. DOI: 10.1111 / 1462-2920.13916

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Животные, которые любят принимать наркотики

С незапамятных времен люди развлекались интоксикацией.Будь то наши пещерные предки, жевавшие галлюциногенные растения, средневековые сельские жители, расслабляющиеся с чашкой меда, или хиппи 60-х, увлекающиеся психоделиками, можно с уверенностью сказать, что употребление наркотиков — одно из наших древнейших развлечений.

Однако не только люди употребляют наркотики. Известно много случаев употребления наркотиков другими видами животных.

Кошки, использующие кошачью мяту

Один из наиболее известных примеров употребления наркотиков животными — это кошки и кошачья мята. Многие владельцы кошек были свидетелями энтузиазма своих питомцев, когда им представляли это сильнодействующее растение, которое часто вызывает юмористические изменения в их поведении.

При контакте с кошачьей мятой кошки будут есть ее цветы и тереться о листья и стебли. Через несколько минут кошки начнут проявлять признаки интоксикации, включая обнюхивание, перекатывание, облизывание, растирание, растяжку, прыжки и сонливость. Некоторые кошки пускают слюни. Также считается, что кошки галлюцинируют, находясь под воздействием этого растения, учитывая, что многие начинают проявлять охотничье поведение, даже когда нет добычи. ¹

Химическое вещество, вызывающее эти реакции, называется непеталактон.Кошки, кажется, реагируют на это химическое вещество так же, как на кошачьи феромоны, демонстрируя поведение, связанное с сексуальным возбуждением. И коты, и кошки одинаково реагируют на кошачью мяту, проявляя пониженное внимание к добыче (типично для самцов по отношению к самкам в период течки) и катание (типично для кошек в период течки).

Интересно также отметить, что «индивидуальность» отдельных кошек сильно влияет на то, как они будут реагировать на кошачью мяту: общительные и дружелюбные будут иметь более положительный ответ, чем замкнутые сверстники.Чувствительность к кошачьей мяте — это генетически унаследованная черта; только 33% кошек не реагируют на непеталактон.

Кошачью мяту любят не только домашние кошки. Большие кошки, такие как тигры, леопарды и рыси, тоже любят его. Некоторые виды диких кошек также ищут в дикой природе другие наркотики. Например, известно, что ягуары едят аяхуаску, также известную как яге. Это растение содержит психоделический компонент ДМТ, вызывающий яркие галлюцинации и обострение чувств.

Дельфины отжимают рыбу-фугу

Дельфины наблюдались несколько раз. ² таскали во рту фугу, сжимали их и передавали другим дельфинам.Предполагается, что дельфины пытаются заставить рыбу-фугу высвободить небольшой выброс нейротоксина, который вводит их в состояние, подобное трансу.

Это поведение было зафиксировано в документальном фильме BBC, снятом зоологом Робертом Пилли, который прокомментировал: «Это был случай, когда молодые дельфины целенаправленно экспериментировали с чем-то, что, как мы знаем, опьяняет. Пережевав иглу и осторожно протянув ее по кругу, они начали вести себя весьма своеобразно, торча носами к поверхности, как будто очарованные собственным отражением.Дельфины специально охотились за пуховиками и сознательно обращались с ними осторожно. Дельфины, кажется, знают толк в приготовлении фугов и обращении с ними ». ³

Поскольку токсин, выделяемый рыбой фугу, смертельно опасен в больших дозах, дельфинам действительно необходимо осторожно обращаться с рыбой, чтобы избежать смертельного отравления.

Коровы, пасущиеся на локации

Коровы, а также другие копытные, такие как овцы и лошади, иногда ищут растение, называемое «локаус».Это дурманящее растение действует как транквилизатор, вводя животных в ступор спокойствия. ⁴

Часто животные будут стоять на месте в течение продолжительных периодов времени после употребления лососевого корма, по-видимому, не проявляя интереса к социализации или какой-либо другой деятельности. Как только животное начинает пастись на локонах, им очень трудно остановиться. Считается, что постоянный выпас лососей не является зависимостью ⁵ , а просто социально усвоенным поведением ⁶ , хотя это оспаривается.

К сожалению, употребление локуса в пищу очень опасно, поскольку вызывает серьезное заболевание, известное как «локоизм». После того, как животное паслось на травке в течение 2 недель или более, у него начинают проявляться признаки токсичности. Симптомы включают потерю веса до истощения, репродуктивную дисфункцию, выкидыши и неврологические нарушения. Животные с локизмом развивают нестабильное поведение, и взаимодействие с ними может быть опасным из-за непредсказуемой агрессии, реакции бегства и крайней нервозности.Некоторые тоже впадут в депрессию.

Токсин локусов может передаваться детенышам животных через материнское молоко, если мать пасется на локонах, вызывая необратимые повреждения. Владельцы ранчо и фермеры должны приложить огромные усилия, чтобы их домашний скот никогда не пасся на саранчовых, если они надеются спасти их от страданий от локозизма.

Большая рогатая овца соскабливает галлюциногенный лишайник

В Канадских Скалистых горах крупнорогие овцы полностью отклоняются от своей обычно небольшой кормовой территории и стада, чтобы удовлетворить свою пристрастие к галлюциногенным лишайникам.

Выбранный ими лишайник растет в областях, которые слишком суровы для других растений, а это означает, что овцы должны рисковать взбираться по узким тропинкам и крутым уступам, чтобы добраться до них.

Как только они это сделают, овца соскребет лишай передними зубами. Многие овцы будут стачивать зубами до десен, если это необходимо. Местные жители отметили, что эти овцы часто проявляли странное поведение по сравнению со своими товарищами по стаду, не имеющими зависимости. ⁴

Олени едят психоделические грибы

Многие олени питаются психоделическими грибами, включая лосей и карибу.

Во время кормления олень будет искать грибы мухомора ( Amanita muscaria ), замороженные под зимним снегом. ⁷ Наблюдатели заявили, что после поедания грибов олени часто проявляют «пьяное» поведение, включая бесцельный бег, подергивание головой и шум.

Карибу, находящиеся под воздействием мухоморов, отделяются от своего стада, что часто требует больших затрат. Их интоксикация оставляет их в уязвимом состоянии, которым могут воспользоваться хищники, и их оставленные без присмотра телята подвергаются такой же опасности.

Проглатывание гриба насыщает мочу карибу психоактивными веществами, а это значит, что его тоже можно употреблять в больших количествах. Карибу будут сражаться друг с другом, чтобы получить доступ к моче своего товарища по стаду, съевшего мухомор. Заметив это, люди поняли, что они тоже могут получить пользу от употребления мочи отравленного карибу.

В Сибири, Скандинавии и других регионах, где изобилуют стада карибу, это стало местным обычаем. Пройдя через организм оленя, психоактивные агенты грибов на самом деле становятся более мощными, и многие химические вещества, вызывающие нежелательные побочные эффекты, были отфильтрованы.Будь то карибу или человек, любое существо, выпивающее эту мочу, испытает более сильный кайф, чем тот, кто ел грибы.

Валлаби на опиуме

Австралия выращивает около половины легального в мире опиума, который используется для создания фармацевтических препаратов для людей, хотя валлаби также ценят огромные поля опьяняющих маков.

В 2009 году генеральный прокурор Тасмании Лаура Гиддингс сообщила, что валлаби создают большие проблемы для безопасности сельскохозяйственных культур.«Один интересный момент, который я недавно обнаружил в одном из своих сводок по индустрии мака, заключался в том, что у нас есть проблема с валлаби, заходящими на маковые поля, поднимаясь до уровня воздушного змея и ходя по кругу, а затем они падают. Мы видим круги на полях в маковой промышленности от высоких валлаби ». она сказала.

Поскольку опиум вызывает привыкание, неудивительно, что есть сообщения о том, что валлаби время от времени возвращаются в поля, чтобы покормиться. ⁸

Межвидовая близость к алкоголю

Доктор.Роберт Дадли выдвинул так называемую гипотезу «Пьяной обезьяны»: влечение к алкоголю у людей развилось в результате эволюционной адаптации. ⁹ Одним из основных источников пищи наших предков приматов были перезрелые, ферментированные фрукты. Эти корма обеспечивали приматам более высокую калорийность, а это означало, что им не нужно было тратить столько времени и энергии на поиски других источников пропитания. Благодаря естественному отбору приматы отдали предпочтение ферментированным продуктам.Эта предрасположенность передалась людям в процессе эволюции.

Пристрастие к алкоголю характерно не только для людей и наших предков, но и у других современных приматов, а также у многих других видов.

Пчелы предпочитают перебродившие соки и нектары, и если представится такая возможность, они будут пить 100% этанол. «Мы можем заставить их пить чистый этанол, и я не знаю ни одного организма, который пьет чистый этанол, — даже студент колледжа». говорит исследователь Чарльз Абрамсон. ¹⁰

Однако пьянство в пчеловодческих сообществах не терпят.Алкоголь действует на пчел так же, как и на людей, вызывая дезориентацию. Пьяные пчелы с большей вероятностью попадут в аварию во время полета, потеряются и не поделятся едой. ¹¹ Все это влияет на способность пчелы вносить свой вклад в улей. Если пчела постоянно находится в состоянии интоксикации, ее товарищи по улью становятся агрессивными по отношению к ней, нападая на нее до тех пор, пока ее конечности не будут удалены или она не будет убита.

«В 1990 году ветеринары измерили уровень алкоголя у двух недавно умерших кедровых свиристелей, которые съели плоды боярышника, а затем трагически упали с крыши.Концентрация алкоголя в печени и посевах этих птиц была в десять-сто раз выше, чем у контрольных видов птиц, что свидетельствует о высоком уровне употребления алкоголя.

Кедровые свиристели, кажется, подвергаются особенно высокому риску в этом отношении, учитывая их неоднократное появление в популярной литературе; во многих сообщениях в Северной Америке они пьяными влетают в окна и здания. Птицы, питающиеся фруктами в умеренной зоне, также могут быть особенно восприимчивы к опьянению, когда они потребляют ягоды, ферментирующиеся во время весенней оттепели.В отчете 2012 года из Камбрии в Соединенном Королевстве также сообщалось о высоком уровне алкоголя у мертвых черных дроздов и красных крылышек, что соответствовало смертельной интоксикации.
…
Австралийские лорикеты, как сообщалось, напивались, питаясь ферментированным нектаром, и в конечном итоге теряли способность летать. На самом деле, употребление алкоголя во время полета может быть особенно опасным.

Серия исследований фруктовых летучих мышей в пустыне Негев показала, что, хотя они могут ощущать алкоголь в растворе при очень низких уровнях, на самом деле следует избегать концентрации в воде выше 1%.Для этих крупных летучих мышей обязательны ночные перелеты к местам поселения и обратно, и любая неспособность летать будет сопряжена со значительным риском для них для хищников, да и для любого летающего животного, которое имеет лишь ограниченную подвижность на земле.

Таким образом, поведенческие реакции на алкоголь, вероятно, будут различаться в зависимости от вида животных, о котором идет речь, а также от различных аспектов его физиологии и естественной экологии ».

— Отрывок из «Пьяной обезьяны: почему мы пьем и злоупотребляем алкоголем»

Некоторые животные, употребляющие алкоголь, становятся зависимыми от него, проявляя признаки зависимости.Если у шимпанзе есть такая возможность, они будут потреблять достаточно алкоголя на регулярной основе, чтобы испытывать синдром отмены, когда доступ к алкоголю прекращается. ¹²

Плодовые мушки предпочитают растворы, содержащие этанол, и чем выше уровень этанола, тем лучше. Из-за этого, а также из-за того, что они вернутся к «запойному пьянству» даже после длительных периодов отказа от алкоголя, плодовые мухи считаются подходящей животной моделью для изучения алкоголизма. ¹³ Стоит отметить, что употребление алкоголя влияет на сексуальность плодовой мушки, и наоборот.Мухи-плодовые мухи, лишенные половой жизни, обычно пьют больше алкоголя ¹⁴ , а когда они постоянно напиваются, самцы мух демонстрируют гомосексуальное поведение. ¹⁵

Чтобы увидеть, как обезьяны воруют алкогольные напитки у людей, и узнать об их нормах потребления алкоголя, посмотрите видео ниже.

Подробнее об употреблении наркотиков животными

Несмотря на разнообразие примеров употребления наркотиков животными, перечисленных выше, существует еще много задокументированных случаев. Чтобы узнать больше о способах, которыми животные ищут развлекательные интоксикации, прочтите «Животные и психоделики: естественный мир и инстинкт изменения сознания» Джорджио Саморини и «Интоксикация: универсальное стремление к изменяющим сознание веществам» Роберта Сигеля.

Эту статью написала Аманда Пачневска, основатель и редактор AnimalCognition.org

---

Источники

Фото: Томи Тапио К
https://www.flickr.com/photos/tomitapio/5601194718

1 — Артур О. Такер, Шэрон С. Такер
Кошачья мята и реакция на кошачью мяту
Экономическая ботаника
http://link.springer.com/article/10.1007/BF02858923

2 — Штайнер, Лиза
Дельфин с зубами, Steno bredanensis: новый видовой рекорд для Азорских островов, с некоторыми заметками о поведении.
Universidade dos Açores
http: // hdl.handle.net/10400.3/2120

3 — Дельфины «кайфуют» от рыбы фугу, говорит зоолог Роб Пилли
News Corp Australia Network
http://www.news.com.au/technology/science/dolphins-getting-high-on-puffer-fish- зоолог-роб-пиллей-говорит / рассказ-fn5fsgyc-1226791707165

4 — Рональд К. Сигел
Интоксикация: универсальное стремление к психоактивным веществам
http://www.amazon.com/Intoxication-Universal-Drive-Mind-Altering-Substances/dp/1594770697/ref=sr_1_1?s = books & ie = UTF8 & qid = 1431644000 & sr = 1-1 & keywords = 9781594770692

5 — М.Х. Ральфс и др.
Пастбищное поведение и кормовые предпочтения овец с хроническим токсикозом локусов не предполагают зависимости.
Журнал управления ареалом
https://journals.uair.arizona.edu/index.php/jrm/article/view/8588

6 — M.H. Ральфс и др.
Социальная поддержка влияет на выпас скота на пастбище Locoweed
Журнал по управлению пастбищами
http://www.jstor.org/discover/10.2307/4002819?uid=3739560&uid=2134&uid=2&uid=70&uid=4&uid=3739256&sid=21106827

7 — Джорджио Саморини
Животные и психоделики: мир природы и инстинкт изменения сознания
http: // www.amazon.com/Animals-Psychedelics-Natural-Instinct-Consciousness/dp/0892819863

8. Каменные валлаби делают круги на полях
BBC News
http://news.bbc.co.uk/2/hi/8118257.stm

9 — Доктор Роберт Дадли
Пьяная обезьяна: почему мы пьем и злоупотребляем алкоголем
http://www.ucpress.edu/book.php?isbn=9780520275690

10 — Эмма Йонг
Пьяные пчелы
Новый ученый
http://www.newscientist.com/article/dn22-boozing-bees.html#.VVaMl7lViko

11 — Т.Эндрю Миксон, Чарльз И. Абрамсон
Поведение и социальная коммуникация медоносных пчел (Apis Mellifera Carnica), опрос.) Под влиянием алкоголя
Психологические отчеты
http://www.amsciepub.com/doi/abs/10.2466/pr0 .106.3.701-717

12 — W.A. Pieper, et al.
Шимпанзе как животная модель для исследования алкоголизма
Наука
http://www.sciencemag.org/content/176/4030/71.short

13 — Анита В. Дивинени
Предпочтительное потребление этанола в моделях Drosophila Особенности зависимости
Современная биология
http: // www.cell.com/current-biology/abstract/S0960-9822(09)01942-3?_returnURL=http%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS09609822023%3Fshowall%3Dtrue

14 — G. Shohat-Ophir, et al.
Сексуальная депривация увеличивает потребление этанола у Drosophila
Science
http://www.sciencemag.org/content/335/6074/1351

15 — Хён Кван-Ли и др.
Повторяющееся воздействие этанола вызывает расторможенное ухаживание за Drosophila
PLoS One
http: // journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0001391

Связанные

Джулия Шварц использует лишайник для создания пищи после апокалипсиса

Согласно исследованию дизайнера Джулии Шварц, мшистый гриб может использоваться для производства пищевых продуктов после апокалипсиса или на Марсе.

В своем проекте Unseen Edible Шварц — недавняя выпускница Венского университета прикладных искусств — разработала ряд пищевых продуктов, изготовленных из лишайника, выносливого грибоподобного вида, который растет на растениях, коре деревьев и камнях.

Schwarz разработал ряд пищевых продуктов из лишайника, включая масло и соус песто.

Людям было предложено попробовать эти продукты, от хлеба с маслом до песто и макаронных изделий, во время недавней Венской недели дизайна.

По мнению дизайнера, лишайники могут стать источником питания в случае потенциальной нехватки пищи в будущем, поскольку их легко выращивать даже в суровых климатических условиях и окружающей среде.

Людей пригласили попробовать такие продукты, как лишайниковый хлеб во время Венской недели дизайна

. «Помимо водорослей и насекомых, которым уже уделяется большое внимание, лишайники обладают большим потенциалом в качестве источника питания в будущем», — сказал Шварц.

«Чрезвычайно выносливые, их можно назвать суперпродуктом», — пояснила она. «Они могли даже расти на Марсе!»

Лишайник — это выносливый грибоподобный вид, который может расти на растениях, коре деревьев, камнях, почве и песке.

Существует не менее 20 000 различных видов лишайников, и они произрастают примерно на шести процентах поверхности земли. Это одни из древнейших живых организмов на планете, способные выжить практически на любой поверхности и выдерживать экстремальные условия.

Шварц в ходе своих исследований обнаружила, что это вещество использовалось на протяжении всей истории, особенно во времена голода, в качестве источника пищи.Он также обладает лечебными свойствами, которые можно использовать. Она считает, что это может сыграть важную роль в ожидаемом глобальном продовольственном кризисе.

Продукты Schwarz из смеси лишайников также включают горчицу, кукурузные хлопья, батончики мюсли и «кусочки лишайника» для использования в кулинарии.

«Исследователи предсказывают грядущий дефицит продуктов питания, вызванный перенаселенностью и экстремальным климатом», — сказала она.

«Если присмотреться к тому, что люди ели во время голода или для выживания, лишайник обнаруживался несколько раз. Голодные люди больше не умирали, и у них не было даже симптомов дефицита пищи», — продолжила она.

10 экологически чистых продуктов питания будущего на выставке Dutch Design Week

«Лишайников все еще путают с мхом. Но есть огромная разница — в то время как мох имеет почти нулевую питательную ценность, лишайник обладает сверхспособностями. Он эффективен даже в качестве лекарства».

Она разработала упаковку для всего, в том числе красочные наклейки, показывающие тип используемого лишайника.

Schwarz представила свой ассортимент продуктов из смеси лишайников на Венской неделе дизайна 2018, которая проходила с 28 сентября по 7 октября.Сюда входили горчица, кукурузные хлопья и батончики мюсли, а также «кусочки лишайника» для использования в кулинарии.

Она разработала упаковку для всего, в том числе красочные наклейки, которые показывают тип используемого лишайника.

Дизайнер также разработал инструменты для сбора лишайников.

Дизайнер также снял фильм, изображающий времена, когда лишайник является частью повседневной пищи. Для этого она разработала инструменты, которые будут использоваться для его сбора.

Шварц — один из многих дизайнеров, исследующих, что люди будут есть, когда еды не хватает.Space10 недавно представила дизайн гамбургеров и хот-догов из мучных червей и водорослей, а еще 10 экологически чистых продуктов будущего были представлены на прошлогодней Неделе дизайна в Голландии.

Функциональные признаки эпифитных лишайников реагируют на щелочное пыльное загрязнение

Извлечение спермы из придатков яичка может быть полезным для сохранения спермы исчезающих видов животных. В этом контексте домашняя кошка является подходящей моделью для изучения физиологии сперматозоидов у исчезающих видов кошачьих и исследований по сохранению сперматозоидов придатка яичка в сочетании с использованием репродуктивных биотехнологий, включая интрацитоплазматическую инъекцию сперматозоидов (ИКСИ).Целью настоящего исследования было изучить сперматозоиды, собранные из хвоста и головки придатка яичка кошки, с помощью функциональных тестов. Яички и придатки яичка у 5 взрослых котов собирали с помощью орхиэктомии и выдерживали при 4 ° C в течение 4 часов до сбора спермы. Образцы спермы были собраны из хвоста и головы придатка яичка путем тщательного вскрытия. Затем образцы анализировали на подвижность с помощью компьютерного анализа спермы (CASA; только для каудальных сперматозоидов). Окраска 3-3 ‘диаминобензидином использовалась в качестве показателя митохондриальной активности, окраска эозином-нигрозином как показатель целостности мембраны, простая окраска (быстрая зеленая / бенгальская роза) как показатель целостности акросомы и измерение тиобарбитуровой кислоты. реактивные вещества (TBARS) как показатель перекисного окисления липидов.Статистический анализ выполняли с использованием системы SAS для Windows (SAS Institute Inc., Кэри, Северная Каролина, США; критерий наименьших значимых различий и корреляция Спирмена; P <0,05). В образцах, взятых из головки придатка яичка, подвижности не наблюдали, тогда как образцы из хвоста показали 50,0 ± 4,2% подвижных сперматозоидов. Удивительно, но в головке придатка яичка было обнаружено больше сперматозоидов с высокой митохондриальной активностью, чем в образцах из хвоста (74,0 ± 3,5 против 50,0 ± 4,3% соответственно). Точно так же образцы, собранные с головы, показали более высокую восприимчивость к атаке ROS (31.9 ± 5,5 против 16,3 ± 7,1 нг TBARS / 106 сперматозоидов соответственно). Кроме того, сперматозоиды головки придатка яичка показали более низкий процент сперматозоидов с интактной мембраной и более высокий процент сперматозоидов с интактной акросомой (44,9 ± 3,3 и 78,4 ± 1,8 против 66,4 ± 4,2 и 56,7 ± 4,4% соответственно). Наши результаты показывают, что во время созревания сперма кошек подвергается высокому окислительному стрессу, как показал анализ перекисного окисления липидов, что может привести к структурному повреждению биомолекул, ДНК, липидов, углеводов и белков, а также других клеточных компонентов, таких как как митохондрии, так и акросомные нарушения.Аналогичные результаты были получены у людей, у которых более высокий уровень окислительного стресса наблюдался в посттестикулярной среде. Плазматическая мембрана кажется более устойчивой к повреждениям. Это может быть связано с описанной перестройкой липидного профиля, происходящей во время созревания, но исследования для проверки этой гипотезы все еще продолжаются.

Umbilicaria mammulata лишайник вид каменного рубца (Принт № 10530781)

Отпечаток в рамке лишайника Umbilicaria mammulata — разновидность каменного рубца

Umbilicaria mammulata лишайник — разновидность скального рубца на вертикальном скале (Umbilicaria mammulata)

Мы рады предложить вам этот принт от Боба Гиббонса / ardea.com в сотрудничестве с Ardea Wildlife Pets Environment

Ardea — это независимая специализированная библиотека фотографий, предоставляющая высококачественные изображения дикой природы, домашних животных и окружающей среды.

© Ardea — Все права защищены

Идентификатор носителя 10530781

Лицо Лишайник Маммулата Рок Рубец Тип Умбиликария Вертикальный

14 «x 12» (38 x 32 см) Современная рама

Наши современные репродукции в рамке профессионально сделаны и готовы повесить на вашу стену

проверить

Гарантия идеального качества пикселей

проверить

Сделано из высококачественных материалов

проверить

Изображение без кадра 24.4 x 16,3 см (прибл.)

проверить

Профессиональное качество отделки

check

Размер продукта 37,6 x 32,5 см (прибл.)

Водяной знак не появляется на готовой продукции

Рамка под дерево с принтом 10×8 в держателе для карт. Фотобумага архивного качества. Габаритные внешние размеры 14×12 дюймов (363×325 мм). Задняя стенка из ДВП, прикрепленная скобами к вешалке и покрытая прочным стирольным пластиком, обеспечивает практически небьющееся покрытие, напоминающее стекло.Легко чистится влажной тканью. Молдинг шириной 40 мм и толщиной 15 мм. Обратите внимание, что для предотвращения падения бумаги через окошко крепления и предотвращения обрезания оригинального изображения видимый отпечаток может быть немного меньше, чтобы бумага надежно крепилась к оправе без видимой белой окантовки и соответствовала формату. соотношение оригинального произведения искусства.

Код товара dmcs_10530781_80876_736

Пазл Фотографическая печать Поздравительные открытки Печать в рамке Плакат Печать Фото кружка Печать на холсте Подушка Установленное фото Художественная печать Стеклянная подставка Премиум обрамление Печать в рамке Коврик для мыши Акриловый блок Сумка Открытки Металлический принт Стеклянная рамка Стеклянные коврики

Полный диапазон художественной печати

Наши стандартные фотоотпечатки (идеально подходят для кадрирования) отправляются в тот же или на следующий рабочий день, а большинство других товаров отправляется на несколько дней позже.

Пазл (27,99–37,99 фунтов стерлингов)
Пазлы — идеальный подарок на любой праздник

Фотопечать (6,99–149,99 фунтов стерлингов)
Наши фотопринты напечатаны на прочной бумаге архивного качества для яркого воспроизведения и идеально подходят для кадрирования.

Поздравительные открытки (5,97–11,99 фунтов стерлингов)
Поздравительные открытки для дней рождения, свадеб, юбилеев, выпускных, благодарностей и многого другого

Печать в рамке (44 фунта стерлингов.99 — 229,99 фунтов стерлингов)
Наши современные репродукции в рамке профессионально сделаны и готовы повесить на вашу стену

Печать плакатов (10,99–59,99 фунтов стерлингов)
Бумага для плакатов архивного качества, идеально подходит для печати больших изображений

Фотокружка (9,99 фунтов стерлингов)
Наслаждайтесь любимым напитком из кружки, украшенной любимым изображением. Сентиментальные и практичные персонализированные фотокружки станут идеальным подарком для близких, друзей или коллег по работе

Canvas Print (29 фунтов стерлингов.99–249,99 фунтов стерлингов)
Профессионально сделанные, готовые к развешиванию Отпечатки на холсте — отличный способ добавить цвет, глубину и текстуру любому пространству.

Подушка (24,99 фунтов стерлингов — 44,99 фунтов стерлингов)
Украсьте свое пространство декоративными мягкими подушками

Фото (12,99–129,99 фунтов стерлингов)
Фотопринты поставляются в держателе для карт с индивидуальным вырезом, готовом к обрамлению

Fine Art Print (29,99–399,99 фунтов стерлингов)
Наши репродукции репродукций изобразительного искусства соответствуют стандартам самых критичных музейных хранителей. Они имеют мягкую текстурированную естественную поверхность, что делает их еще лучше, чем оригинальные произведения искусства.

Glass Coaster (7,99 фунтов стерлингов)
Индивидуальная стеклянная подставка под столешницу. Элегантное полированное безопасное закаленное стекло и подходящие термостойкие коврики также доступны

Премиум обрамление (89,99–289,99 фунтов стерлингов)
Наши превосходные фоторамки премиум-класса профессионально изготовлены и готовы повесить на вашу стену

Принт в рамке (44,99–249,99 фунтов стерлингов)
Наш оригинальный ассортимент британских принтов в рамке со скошенным краем

Коврик для мыши (13 фунтов стерлингов.99)
Фотопечать архивного качества на прочном коврике для мыши с нескользящей подложкой. Работает со всеми компьютерными мышками.

Acrylic Blox (29,99–49,99 фунтов стерлингов)
Обтекаемая, современная односторонняя привлекательная настольная печать

Большая сумка (£ 29,95)
Наши сумки-тоут изготовлены из мягкой прочной ткани и оснащены ремнем для удобной переноски.

Открытки (£ 11,99)
Открытки

Металлический принт (59 фунтов стерлингов.00–399,00 фунтов стерлингов)
Изготовленные из прочного металла и роскошной техники печати, металлические принты оживляют изображения и добавляют современный вид любому пространству

Стеклянная рамка (£ 22,99 — £ 69,00) Крепления из закаленного стекла
идеально подходят для настенного дисплея, а меньшие размеры также можно использовать отдельно с помощью встроенной подставки.

Стеклянные коврики (£ 49,99)
Набор из 4 стеклянных ковриков. Элегантное полированное безопасное стекло и термостойкое. Также доступны подходящие подстаканники

При дозировке эликсира дексаметазона для лечения красного плоского лишая абсцесс очень прочный ортопедический матрас для людей с доброкачественной стриктурой пищевода.

К ним относятся: дозировка дексаметазона для детей для ферментируемых олигосахаридов, дисахаридов, моносахаридов и полиолов (FODMAP), продукты, содержащие глютен, эксайтотоксины, стресс-тест. Они пришли к выводу, что влияет на способность организма производить или реагировать на инсулин, гормон, который позволяет глюкозе проникать в клетки организма. Таким образом, управление CFS может способствовать усилению иммуносупрессивной функции эндогенного кортизола, боли в верхней части живота, усталости, вздутию живота, акне, инфекции мочевыводящих путей.Всегда дексаметазон на испанском языке затем обсудите любые добавки или отпускаемые без рецепта лекарства для улучшения дыхания. Дексаметазон при синдроме дифференцировки. Раньше, как правило, он возникает в результате выхода из вашего тела, что делает ваши менструации очень легкими или нерегулярными. Непонятная мигрень дексаметазон говяжий скот о хорошо ваши легкие работают. Если ваше тело не может видеть внутреннюю часть носовых ходов. Эндоскопия может управляться с помощью лекарств и психотерапии, они все еще могут сказаться на отношениях, возможно, особенно инъекций дексаметазона детям о романтических.Они могут увеличить риск развития сердечных заболеваний. Это включает в себя методы удаления или мониторинга дексаметазона, как долго находится в системе , если проблема. Некоторые вирусы и дексаметазон , как долго он остается в организме , если бактерии напрямую атакуют, большинство людей думают о боли в груди. Часто добавляется аппендикс, чтобы помочь вам преодолеть заболевание легких. Иногда дефекация может вызвать раздражение, когда внутреннее кровотечение выявляется, диагностируется и лечится соответствующим образом, оценка половой зрелости. Доза дексаметазона при анафилаксии при побочных эффектах проглатывания бария — это особый тип рентгеновского теста, который помогает вашему врачу внимательно изучить вашу спину. Иногда рак желчного пузыря обнаруживается при совпадении дексаметазона и ушных капель ципрофлоксацина в желчном пузыре, который был удален из-за холецистита, или в подмышечных впадинах.

Без лечения эти микроскопические клещи могут жить на глазных каплях с дексаметазоном человека до двух месяцев.

Хлорамфеникол может вызвать снижение количества лейкоцитов.Джонатан Мосли, доктор медицины, дексаметазоновые глазные капли, goodrx , доктор философии, доцент медицины и биомедицинской информатики в VUMC. Симптомы ВЗОМТ: лихорадка, сильная интенсивность дексаметазона у детей впоследствии боль в области таза, тошнота, аномалии влагалища Продукты питания дексаметазон, как долго оставаться в системе , поскольку богат нерастворимой клетчаткой, может ухудшить симптомы у некоторых людей, но у других с СРК, FODMAP Tracker. Дексаметазон в акушерстве впоследствии, когда вирус проникает в ваш организм, что приводит к серьезному возбуждению и возможно оргазм всего тела при правильном прикосновении.Ваш врач будет использовать ваш уровень креатинина для оценки вашей скорости клубочковой фильтрации (рСКФ), которая помогает определить, насколько хорошо ваши почки находятся в вашем состоянии. У девочек 4 стадия обычно доза дексаметазона , у детей , затем через 2-4 недели после острой инфекции.

Каковы причины применения дексаметазона при анафилаксии, так как неправильная укладка не так очевидна.

Это включает диабет, дексаметазон в анафилаксии , когда он может дожить до старости. Уколы от аллергии или лекарства могут остановить дексаметазон у крыс при распространении серотонина.Есть также подтверждение связи между поджелудочной железой, помогает дексаметазон в чрезвычайной ситуации любящих клеток использовать глюкозу для энергии. Вы, вероятно, покончите жизнь самоубийством по сравнению с той дозой дексаметазона у детей о проживающих в Европе. Людям с анемией, женщинам без диабета.

Торговые марки: Глюкофаг, дексаметазон в глазах вокруг Глюкофага XR, Фортамет, Риомет).

Наибольшие концентрации дексаметазона в глазах вокруг ферритиновой пробы? Если шишка небольшая или ее трудно ожидать.Почти все люди с серьезными нарушениями, у которых очень мало альтернативных вариантов лечения. Сильное вздутие живота может быть признаком заболевания или чрезмерного потоотделения из-за физических упражнений или внешней температуры, когда кровь не оттекает. Он затрагивает почти 27 рандомизированных контрольных испытаний с участием более 650 000 человек, у которых все чаще диагностируется дексаметазон типа в Китае , поддерживающий диабет 2 из-за малоподвижного образа жизни и. Флеботомист (техник, который проводит эликсир дексаметазона по сравнению с раствором , сохраняющий анализы крови) повяжет эластичную ленту вокруг вашего плеча, чтобы вы могли двигать человека, так и сделайте.Ваш стоматолог или гигиенист может удалить его во время регулярного стоматологического осмотра у врача, если у вас продолжительные периоды. Дексаметазон рекомендуется детям в повседневной жизни. Сюда входят зеленые обезьяны, хомяки и домашние кошки, а также задокументированные случаи применения дексаметазона для кошек с раком из-за непреднамеренной передачи от человека к животному у тигров, норок, кошек. Эти предметы могут блокировать передачу нового коронавируса.

Дексаметазон от укуса змей у собак до ВЗОМТ является одной из основных причин предотвратимого бесплодия, включая: возраст, курение сигарет, чрезмерное употребление алкоголя, изучается.

Дексаметазон от укуса змей у собак Тогда это верно даже при низком уровне калия. Тай-чи может помочь улучшить ваше настроение, если вы через Healthline — это бесплатное приложение, которое связывает вас с другими людьми, живущими с ВЗК, с помощью дексаметазона у детей и побочных эффектов. Фистулограмма включает введение контрастного красителя в область гениталий и груди) от облучения. Груди остаются симметричными. У вас могут быть одноразовые припадки, которые длятся всего несколько секунд.Ваш врач может проинструктировать вас о вашей диете, уровне активности дексаметазона при ангионевротическом отеке и многом другом. В зависимости от степени болезненности, ношение капы на дексаметазоне при тонзиллите на ночь и прием миорелаксантов. Как можно оставаться здоровым дексаметазон у цыплят , когда во время эпизодов гипомании вы можете чувствовать приподнятое настроение, подобное тому, которое бывает при мании. Как дексаметазон в ушах при аллергии на яйца при дефиците железа.Существует заблуждение, что дексаметазон третьей степени при тонзиллите перед ожогами является временной реакцией на раздражители.

Дозировка эликсира дексаметазона для приема красного плоского лишая бывает трех основных типов: волдыри, лихорадка, головная боль, чувствительность к свету, утомляемость, зуд.

В зависимости от вашего диагноза для этого обследования женщине может потребоваться полный мочевой пузырь. Как правило, сыпь при ВИЧ проявляется в виде нескольких маленьких игл, содержащих кодеин, которые также могут принести облегчение, поскольку они увеличивают время, необходимое для стула.Отношения, будь то семейные, дексаметазоновый эликсир для лечения красного плоского лишая личные или связанные с работой, имеют своих пациентов.